RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570124.1

SIN3A-215, Transcript of SIN3 transcription regulator family member A, humanhuman

TSL 2

Gene SIN3A, Length 593 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3A-215ENST00000570124 KLK8O60259 260 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 DFNA5O60443 496 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 KERAO60938 352 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 SLC43A1O75387 559 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 SUPT3HO75486 399 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 DNAJB5O75953 348 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 SLC16A8O95907 504 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 CATP04040 527 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 C8GP07360 202 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 GSTA1P08263 222 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 PKLRP30613 574 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 ALDH3A1P30838 453 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 HPDP32754 393 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 GDF5P43026 501 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 CCR10P46092 362 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 ITGA1P56199 1179 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 OR1D5P58170 312 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 HHEXQ03014 270 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 DUSP2Q05923 314 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 KIR2DS5Q14953 304 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 NR1D2Q14995 579 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 FAM83EQ2M2I3 478 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 BTBD16Q32M84 506 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 PHF19Q5T6S3 580 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 FAM69AQ5T7M9 428 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 DEPDC1Q5TB30 811 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 STPG1Q5TH74 334 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 NKAIN2Q5VXU1 208 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 LIPMQ5VYY2 423 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 AGTRAPQ6RW13 159 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 SUSD1Q6UWL2 747 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 TMEM26Q6ZUK4 368 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 SEM1Q6ZVN7 128 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 TAX1BP1Q86VP1 789 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 GPSM1Q86YR5 675 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 KIAA2013Q8IYS2 634 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 ULK2Q8IYT8 1036 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 AVL9Q8NBF6 648 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 PDPRQ8NCN5 879 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 OR4E2Q8NGC2 313 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 OR9A1PQ8NGU1 263 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 RHEBL1Q8TAI7 183 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 MGARPQ8TDB4 240 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 PYCR2Q96C36 320 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 RHBDF1Q96CC6 855 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 CXorf40BQ96DE9 158 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 TMEM237Q96Q45 408 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 OR4K3Q96R72 315 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 SELENOSQ9BQE4 189 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 NUDT22Q9BRQ3 303 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 PITPNM3Q9BZ71 974 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 C20orf27Q9GZN8 174 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 ATG10Q9H0Y0 220 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 SLC25A32Q9H2D1 315 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 SYNPO2LQ9H987 977 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 RDH14Q9HBH5 336 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 GCM1Q9NP62 436 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 KCNK9Q9NPC2 374 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 POT1Q9NUX5 634 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 ARL15Q9NXU5 204 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 SPHK1Q9NYA1 384 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 TMEM9Q9P0T7 183 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 SENP1Q9P0U3 644 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 LRIT1Q9P2V4 623 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 COPG2Q9UBF2 871 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 DKK4Q9UBT3 224 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 HSF4Q9ULV5 492 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.05□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 AKAP13Q12802 2813 aa5.04□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa5.04□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 A0A1W2PQM1 296 aa5.04□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 CPED1A4D0V7 1026 aa5.04□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 WDR91A4D1P6 747 aa5.04□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 GOLGA6L10A6NI86 522 aa5.04□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 OR5K4A6NMS3 321 aa5.04□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 ZNF785A8K8V0 405 aa5.04□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 E7ENX8 843 aa5.04□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 E2F3O00716 465 aa5.04□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 PPP6CO00743 305 aa5.04□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 OR7A17O14581 309 aa5.04□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 YKT6O15498 198 aa5.04□□□□□ -1.6
SIN3A-215ENST00000570124 FLRT2O43155 660 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms