RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558246.1

AC087477.5-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC087477.5, Length 562 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC087477.5-201ENST00000558246 AGR2O95994 175 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 MT-ND2P03891 347 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 CYP17A1P05093 508 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 CTSLP07711 333 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 ETV6P41212 452 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 CCR2P41597 374 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 LIMS1P48059 325 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 MAPK12P53778 367 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 TAS2R50P59544 299 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 IL1RL1Q01638 556 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 NCF4Q15080 339 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 TIGD6Q17RP2 521 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 TBC1D25Q3MII6 688 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 TMEM201Q5SNT2 666 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 SAXO2Q658L1 398 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 TMEM215Q68D42 235 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 XKR5Q6UX68 686 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 VTCN1Q7Z7D3 282 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 GALNT5Q7Z7M9 940 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 FAM124AQ86V42 546 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 IGFN1Q86VF2 1251 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 TDHQ8IZJ6 230 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 HS3ST5Q8IZT8 346 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 TTC16Q8NEE8 873 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 CDC26Q8NHZ8 85 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 PIK3R3Q92569 461 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 DHRS1Q96LJ7 313 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 ZNF354BQ96LW1 612 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 CSF3RQ99062 836 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 TIMM29Q9BSF4 260 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 OR52A5Q9H2C5 316 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 ANKRD19PQ9H560 264 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 TRPV4Q9HBA0 871 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 BCL2L10Q9HD36 194 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 SEMA3GQ9NS98 782 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 VNN3Q9NY84 501 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 GDE1Q9NZC3 331 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 ERVK-18Q9QC07 812 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 P2RX2Q9UBL9 471 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 RNF6Q9Y252 685 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 CCL26Q9Y258 94 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 ITM2BQ9Y287 266 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 ASF1AQ9Y294 204 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 MYOFQ9NZM1 2061 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 A0A075B6Q4 140 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 GSAPA4D1B5 854 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 ZAR1LA6NP61 321 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 XPNPEP2O43895 674 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 SH3BP5O60239 455 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 PCDHGA12O60330 932 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 C6orf47O95873 294 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 LINC00271P0C7V0 271 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 C6P13671 934 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 OSMP13725 252 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 HLA-EP13747 358 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 CSF2RAP15509 400 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 CBLP22681 906 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 NDUFS1P28331 727 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 FMO3P31513 532 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 BDKRB1P46663 353 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 PREPP48147 710 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 CRISP1P54107 249 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 MANFP55145 182 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 REEP5Q00765 189 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 SLC14A1Q13336 389 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 ITGADQ13349 1161 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 GAB1Q13480 694 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 C1DQ13901 141 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 STARD3Q14849 445 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 SPCS2Q15005 226 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 INAQ16352 499 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 C9orf64Q5T6V5 341 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 METRNLQ641Q3 311 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 FRMPD2BQ6IN97 320 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 PNCKQ6P2M8 343 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 RFLNAQ6ZTI6 216 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 C10orf111Q8N326 155 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 OR8J1Q8NGP2 316 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 MCFD2Q8NI22 146 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 BBS10Q8TAM1 723 aa8.49□□□□□ -1.05
AC087477.5-201ENST00000558246 SUSD6Q92537 303 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms