RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 TUBB8Q3ZCM7 444 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 UNC50Q53HI1 259 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 FAM219BQ5XKK7 198 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 TRIM40Q6P9F5 258 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 LANCL3Q6ZV70 420 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 MILR1Q7Z6M3 343 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 LAS2Q8IYD9 372 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 IQCKQ8N0W5 287 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 C4orf33Q8N1A6 199 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 GALNT16Q8N428 558 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 OR2L5Q8NG80 312 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 HUS1BQ8NHY5 278 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 PPP4R1Q8TF05 950 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 METTL21AQ8WXB1 218 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 CAVIN3Q969G5 261 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 UBE2E3Q969T4 207 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 GAL3ST3Q96A11 431 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 NACC2Q96BF6 587 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 TBC1D20Q96BZ9 403 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 LURAP1Q96LR2 239 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 NUDT9Q9BW91 350 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 MS4A8Q9BY19 250 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 PPCSQ9HAB8 311 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ZNF160Q9HCG1 818 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 PRDM7Q9NQW5 492 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 RAB21Q9UL25 225 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 SPG11Q96JI7 2443 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 A0A1B0GTL3 188 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 MAGEB17A8MXT2 336 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 COPEO14579 308 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 B3GALT2O43825 422 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ZG16O60844 167 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 GLRA3O75311 464 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 CEACAM4O75871 244 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 FHP07954 510 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 RPS17P08708 135 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 NUDT17P0C025 328 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 C8orf89P0DMQ9 161 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 COX6A1P12074 109 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 KRT4P19013 534 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 IMPDH1P20839 514 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 CCT5P48643 541 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 PER3P56645 1201 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 RPS13P62277 151 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 HERVK_113P63132 956 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 Q0VFX4 171 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 RASA2Q15283 850 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 NSDHLQ15738 373 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ADPRMQ3LIE5 342 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ELOA3BQ3SY89 546 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 SGO1Q5FBB7 561 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ZNF678Q5SXM1 525 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 DEPDC1Q5TB30 811 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 NIPAL1Q6NVV3 410 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ABHD17CQ6PCB6 329 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 TMEM205Q6UW68 189 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 NDUFAF7Q7L592 441 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 GDF7Q7Z4P5 450 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 UBE3DQ7Z6J8 389 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 LCA5Q86VQ0 697 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 CA13Q8N1Q1 262 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 L3MBTL4Q8NA19 623 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ELOA3Q8NG57 546 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 OR4F6Q8NGB9 312 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 TRPC4APQ8TEL6 797 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 TSLPQ969D9 159 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 CMTM7Q96FZ5 175 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 VPS50Q96JG6 964 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 PTCHD1Q96NR3 888 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 QRFPRQ96P65 431 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 NTMT1Q9BV86 223 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 ERVK-6Q9BXR3 956 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 LANCL2Q9NS86 450 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 GPR83Q9NYM4 423 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 EMCNQ9ULC0 261 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 GRID1Q9ULK0 1009 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 POLEQ07864 2286 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.03□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 G3V2L1 256 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 H0YIV9 168 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 LRRTM2O43300 516 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-217ENST00000550044 UGDHO60701 494 aa9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.2 ms