RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 IQCCQ4KMZ1 466 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 METTL11BQ5VVY1 283 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 FBXL22Q6P050 247 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 DET1Q7L5Y6 550 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF280BQ86YH2 543 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 MINDY1Q8N5J2 469 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 CAMKVQ8NCB2 501 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 OR52J3Q8NH60 311 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 RHEBL1Q8TAI7 183 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 CD99L2Q8TCZ2 262 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 MFSD3Q96ES6 412 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 SMURF1Q9HCE7 757 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 PLSCR3Q9NRY6 295 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 GULP1Q9UBP9 304 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 OR10H1Q9Y4A9 318 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 G3V2L1 256 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 hCG_2039718K7EN88 272 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 HSPA12AO43301 675 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 RAD1O60671 282 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 F10P00742 488 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 PRH1P02810 166 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 GALTP07902 379 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 CSF3P09919 207 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 RAB8AP61006 207 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 ARL6IP1Q15041 203 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 FAM209BQ5JX69 171 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 WASH2PQ6VEQ5 465 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 ANKLE1Q8NAG6 615 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 OR8J3Q8NGG0 315 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 ARL11Q969Q4 196 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 HMCESQ96FZ2 354 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 TRIB3Q96RU7 358 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF649Q9BS31 505 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 EXO5Q9H790 373 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 PSAT1Q9Y617 370 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 ARPC2O15144 300 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 SOD2P04179 222 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 CSN2P05814 226 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 HNF1AP20823 631 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 CPN2P22792 545 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 CSNK1DP48730 415 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 RGS19P49795 217 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 RAP2BP61225 183 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 AP1S1P61966 158 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 PFKPQ01813 784 aa5.81□□□□□ -1.48
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PTPRD-214ENST00000540109 KLHL24Q6TFL4 600 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 DOCK3Q8IZD9 2030 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 HASPINQ8TF76 798 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF558Q96NG5 402 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 CYP2S1Q96SQ9 504 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 TRIM2Q9C040 744 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 MARCH5Q9NX47 278 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 TVP23AA6NH52 213 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 I6L893 689 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 RHOCP08134 193 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 CD63P08962 238 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 BMP4P12644 408 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 EPHB3P54753 998 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 RBBP4Q09028 425 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 UBXN2BQ14CS0 331 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 CLEC6AQ6EIG7 209 aa5.81□□□□□ -1.48
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PTPRD-214ENST00000540109 LINGO2Q7L985 606 aa5.81□□□□□ -1.48
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PTPRD-214ENST00000540109 TMEM209Q96SK2 561 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 DPP7Q9UHL4 492 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 ACTL7AQ9Y615 435 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 KERAO60938 352 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 SPDEFO95238 335 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 LALBAP00709 142 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 FSHRP23945 695 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 RYKP34925 604 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRD-214ENST00000540109 SUOXP51687 545 aa5.81□□□□□ -1.48
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