RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	CBFA2T2	O43439	604 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	GOSR1	O95249	250 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	ACSL3	O95573	720 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	IFNA16	P05015	189 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	SERPINA6	P08185	405 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	CCND1	P24385	295 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	GABRB3	P28472	473 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	NR1H2	P55055	460 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	SKP1	P63208	163 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	CSHL1	Q14406	222 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	DUPD1	Q68J44	220 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	VASN	Q6EMK4	673 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	LUZP2	Q86TE4	346 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	MORN4	Q8NDC4	146 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	OR8K3	Q8NH51	312 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	PIGT	Q969N2	578 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	HES6	Q96HZ4	224 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	TRIB1	Q96RU8	372 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	LRIT2	A6NDA9	550 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	CD8B2	A6NJW9	211 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	C17orf105	B2RV13	164 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	PFDN6	O15212	129 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	CTNS	O60931	367 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	LDB3	O75112	727 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	C1QA	P02745	245 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	C8G	P07360	202 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	CDKN2D	P55273	166 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	LIM2	P55344	173 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	KCNJ2	P63252	427 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	ACKR1	Q16570	336 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	MPEG1	Q2M385	716 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC89	Q8N998	374 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	TRPV3	Q8NET8	790 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	ISL2	Q96A47	359 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	DSCAM	O60469	2012 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557		A0A087X1B8	175 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	GUCA1C	O95843	209 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	IL18BP	O95998	194 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	IGKV3-11	P04433	115 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	BMP7	P18075	431 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	SAT1	P21673	171 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	CERS1	P27544	350 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	OPRM1	P35372	400 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	KCNJ1	P48048	391 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	PLA2G16	P53816	162 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	EIPR1	Q53HC9	387 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM64	Q6YI46	380 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	KIAA1328	Q86T90	577 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	LIX1	Q8N485	282 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	FBXL8	Q96CD0	374 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	LINGO1	Q96FE5	620 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	MARK4	Q96L34	752 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	CCL19	Q99731	98 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	UBQLN3	Q9H347	655 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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