RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 TSPY8P0CW00 308 aa3.2□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 ANPEPP15144 967 aa3.2□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 OR3A1P47881 315 aa3.2□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 HSPA2P54652 639 aa3.2□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 CEACAM7Q14002 265 aa3.2□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 CDO1Q16878 200 aa3.2□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 TRAT1Q6PIZ9 186 aa3.2□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 ANKRD46Q86W74 232 aa3.2□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 KIAA0895Q8NCT3 520 aa3.2□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 SGF29Q96ES7 293 aa3.2□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 CLEC5AQ9NY25 188 aa3.2□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa3.2□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 PLCH2O75038 1416 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 EEA1Q15075 1411 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 A0A0B4J203 849 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 C5orf52A6NGY3 159 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 SCO2O43819 266 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 GRAP2O75791 330 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 FGF19O95750 216 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 RLN1P04808 185 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 ADARP55265 1226 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 KCTD2Q14681 263 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 Q1RN00 199 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 TEX35Q5T0J7 233 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 FHL5Q5TD97 284 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 NEPROQ6NW34 567 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 CASC4Q6P4E1 433 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 SERINC5Q86VE9 423 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 C4orf19Q8IY42 314 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 NME8Q8N427 588 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 GPR148Q8TDV2 347 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 SEPT8Q92599 483 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 RFT1Q96AA3 541 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 TRIM7Q9C029 511 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 SLITRK2Q9H156 845 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 NMUR1Q9HB89 426 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 ABCB10Q9NRK6 738 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 TMED7Q9Y3B3 224 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 ATP10AO60312 1499 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 UBR1Q8IWV7 1749 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 MROH1Q8NDA8 1641 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 SCAPERQ9BY12 1400 aa3.19□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 IQGAP1P46940 1657 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 FYCO1Q9BQS8 1478 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 TRAV34A0A0B4J273 112 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 ANKDD1BA6NHY2 528 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 H7C0S8 307 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 HAT1O14929 419 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 CTDSPLO15194 276 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 IGHG1P01857 330 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 ID1P41134 155 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 SLC1A6P48664 564 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 RPL34P49207 117 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 SLC22A6Q4U2R8 563 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 MARC1Q5VT66 337 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 PM20D1Q6GTS8 502 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM64Q6YI46 380 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 SLC34A3Q8N130 599 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM99Q8N816 258 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 OR6T1Q8NGN1 323 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 OR6F1Q8NGZ6 308 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 HSD17B14Q9BPX1 270 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 S100A14Q9HCY8 104 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 MED17Q9NVC6 651 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 UBQLN2Q9UHD9 624 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 SPATA2Q9UM82 520 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 FBXO7Q9Y3I1 522 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 POMT1Q9Y6A1 747 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa3.18□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC18Q5T9S5 1454 aa3.17□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 MLH3Q9UHC1 1453 aa3.17□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 ILVBLA1L0T0 632 aa3.17□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 KBTBD13C9JR72 458 aa3.17□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 P2RX6O15547 441 aa3.17□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 ACKR3P25106 362 aa3.17□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP3.17□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 SOAT1P35610 550 aa3.17□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 GP5P40197 560 aa3.17□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 FKBP1BP68106 108 aa3.17□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 TSPY1Q01534 308 aa3.17□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 CRMP1Q14194 572 aa3.17□□□□□ -1.9
CPEB4-210ENST00000522344 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms