RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 ABHD13Q7L211 337 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 PAGE2Q7Z2X7 111 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 PIGWQ7Z7B1 504 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 OR2L5Q8NG80 312 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 GAL3ST3Q96A11 431 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 C3orf30Q96M34 536 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF285Q96NJ3 590 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 F2RL3Q96RI0 385 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 TBCDQ9BTW9 1192 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 SLC6A16Q9GZN6 736 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 OR51B5Q9H339 312 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 AKTIPQ9H8T0 292 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 KCNK13Q9HB14 408 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 LRTM1Q9HBL6 345 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 TCF7L2Q9NQB0 619 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 ENAMQ9NRM1 1142 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 SLC22A11Q9NSA0 550 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 FBXL4Q9UKA2 621 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 TMED5Q9Y3A6 229 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 CCL27Q9Y4X3 112 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 HYKKA2RU49 373 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 FITM1A5D6W6 292 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 GOLGA8OA6NCC3 632 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 ANKUB1A6NFN9 424 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 GOLGA8NF8WBI6 632 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 NDUFAB1O14561 156 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 SNPHO15079 494 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 LSM1O15116 133 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 PEX11AO75192 247 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 SH3BGRLO75368 114 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 CBX6O95503 412 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 JUNP05412 331 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 COL8A1P27658 744 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 TSFMP43897 325 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 ARSFP54793 590 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 HERC3Q15034 1050 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 MUM1Q2TAK8 710 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 PRTGQ2VWP7 1150 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 GALNTL6Q49A17 601 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 C6orf136Q5SQH8 315 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 METTL21CQ5VZV1 264 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 OR4C11Q6IEV9 310 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 IGFL3Q6UXB1 125 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 MAVSQ7Z434 540 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 SPATA19Q7Z5L4 167 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 METTL4Q8N3J2 472 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 RNF175Q8N4F7 328 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 OR2T11Q8NH01 316 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 BCAS4Q8TDM0 211 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 CHTF18Q8WVB6 975 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 FKBP10Q96AY3 582 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 MS4A6EQ96DS6 147 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 KCNC2Q96PR1 638 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 RABEP2Q9H5N1 569 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 CUTCQ9NTM9 273 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 SIRT5Q9NXA8 310 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 ADAM29Q9UKF5 820 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 TRIM33Q9UPN9 1127 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 SLC22A7Q9Y694 548 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 SEC16AO15027 2179 aa10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGAP10A1A4S6 786 aa10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 DSCR3O14972 297 aa10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 UBDO15205 165 aa10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 P2RX6O15547 441 aa10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 ERI3O43414 337 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 ETHE1O95571 254 aa10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 LDLRP01130 860 aa10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 STATHP02808 62 aa10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 ALOX12P18054 663 aa10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 ITGAXP20702 1163 aa10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 MMP11P24347 488 aa10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 SSR2P43308 183 aa10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 PLA2G16P53816 162 aa10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 ERVK-8P63133 956 aa10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 EMX2Q04743 252 aa10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 HYAL2Q12891 473 aa10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 FAM53BQ14153 422 aa10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 HKDC1Q2TB90 917 aa10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 FAM219BQ5XKK7 198 aa10.68□□□□□ -0.7
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF787Q6DD87 383 aa10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms