RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489095.1

TRBV5-2-201, Transcript of T cell receptor beta variable 5-2 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBV5-2, Length 273 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-2-201ENST00000489095 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 SNX8Q9Y5X2 465 aa5.66□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 A0A1W2PQF6 199 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 FAM221BA6H8Z2 402 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 LRIT2A6NDA9 550 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 PRR23AA6NEV1 266 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 TMEM229AB2RXF0 380 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 MAN2B1O00754 1011 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 SLC22A1O15245 554 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 ERI3O43414 337 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 TMPRSS11DO60235 418 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 MITFO75030 526 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 FAM20BO75063 409 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 CCNB2O95067 398 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 ADAP00813 363 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 FHP07954 510 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 HTR1AP08908 422 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 TFPTP0C1Z6 253 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 ACADMP11310 421 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 CDK4P11802 303 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 CYP4B1P13584 511 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 GLULP15104 373 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 PCSK6P29122 969 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 AKT2P31751 481 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 NUDT1P36639 197 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 BCL6P41182 706 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 LIMS1P48059 325 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 SOX9P48436 509 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 CCT3P49368 545 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 CLK3P49761 638 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 ST13P50502 369 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 PLA2G16P53816 162 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 CDH12P55289 794 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 YPEL5P62699 121 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 RPP38P78345 283 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 SLC35A2P78381 396 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 PRR5P85299 388 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 RELAQ04206 551 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 RGS1Q08116 209 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 NDUFA9Q16795 377 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 MICAQ29983 383 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 FBXO43Q4G163 708 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 EOGTQ5NDL2 527 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 MLIPQ5VWP3 458 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 ZNF425Q6IV72 752 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 KIAA1211LQ6NV74 962 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 ABHD17CQ6PCB6 329 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 CEACAM20Q6UY09 585 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 PRSS48Q7RTY5 328 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 C6orf120Q7Z4R8 191 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 UBE3DQ7Z6J8 389 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 P3H2Q8IVL5 708 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 TAGAPQ8N103 731 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 MFSD9Q8NBP5 474 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 OR52E1Q8NGJ3 308 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 BBS10Q8TAM1 723 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 MIPOL1Q8TD10 442 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 LCN9Q8WX39 176 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 MYDGFQ969H8 173 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 GAL3ST3Q96A11 431 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 MARVELD3Q96A59 401 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 THAP11Q96EK4 314 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 SLC35G5Q96KT7 338 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 AMDHD1Q96NU7 426 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 BBS4Q96RK4 519 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 C17orf62Q9BQA9 187 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 DPH7Q9BTV6 452 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 BTBD2Q9BX70 525 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 LHPPQ9H008 270 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 PLGRKTQ9HBL7 147 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 FGF22Q9HCT0 170 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 PALMDQ9NP74 551 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 SLC6A20Q9NP91 592 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 IMPAD1Q9NX62 359 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 CLEC1BQ9P126 229 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 EBF1Q9UH73 591 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 PHF11Q9UIL8 331 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 MOSPD1Q9UJG1 213 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 ACSL6Q9UKU0 697 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 PSME2Q9UL46 239 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 RAB23Q9ULC3 237 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV5-2-201ENST00000489095 TMCC3Q9ULS5 477 aa5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms