RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	CA13	Q8N1Q1	262 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	BMPER	Q8N8U9	685 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF681	Q96N22	645 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	CGREF1	Q99674	301 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	NANOG	Q9H9S0	305 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	STARD5	Q9NSY2	213 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	CD300A	Q9UGN4	299 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A0G2JN53	185 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	RFXANK	O14593	260 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	DSCR3	O14972	297 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	CHST10	O43529	356 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	DNAJA2	O60884	412 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	RFPL3	O75679	317 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	SLITRK5	O94991	958 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	NR2F6	P10588	404 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	HSD17B1	P14061	328 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	CPN2	P22792	545 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	PDX1	P52945	283 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	FXN	Q16595	210 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	PIGG	Q5H8A4	983 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	CPZ	Q66K79	652 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	OR1F2P	Q96R84	312 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	CDRT15	Q96T59	188 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	NDC1	Q9BTX1	674 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	ZMYND15	Q9H091	742 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	RARRES3	Q9UL19	164 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1W2PRB8	838 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	PGRMC2	O15173	223 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CTNS	O60931	367 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	DNAJB6	O75190	326 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	B3GALT4	O96024	378 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	GPX2	P18283	190 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	IL1RN	P18510	177 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP2R1B	P30154	601 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MPI	P34949	423 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	RORA	P35398	523 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNJ2	P63252	427 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	DSG2	Q14126	1118 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	C18orf63	Q68DL7	685 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	DEFB124	Q8NES8	71 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MIEF2	Q96C03	454 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	LRFN5	Q96NI6	719 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	GBP5	Q96PP8	586 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	PANX1	Q96RD7	426 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ZPBP	Q9BS86	351 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	THTPA	Q9BU02	230 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM4	Q9C037	500 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		12.02	□□□□□ -0.49

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