RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464082.1

CD46-211, Transcript of CD46 molecule, humanhuman

TSL 2

Gene CD46, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46-211ENST00000464082 PDE10AQ9Y233 779 aa5.06□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa5.06□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 PSAT1Q9Y617 370 aa5.06□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 SAR1BQ9Y6B6 198 aa5.06□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa5.06□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa5.06□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 ZNF407Q9C0G0 2248 aa5.06□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 NINQ8N4C6 2090 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 A0A0J9YVX5 310 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 A0A1B0GX78 115 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 CTAGE15A4D2H0 777 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 E5RI56 91 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 H0YGG7 62 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 CCDC188H7C350 402 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 SOCS6O14544 535 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 HAT1O14929 419 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 DSCR3O14972 297 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 RAD51CO43502 376 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 KDM1AO60341 852 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 ALOX12BO75342 701 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 PROP1O75360 226 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 PIAS1O75925 651 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 TTC4O95801 387 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 HBQ1P09105 142 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 OR1D4P47884 311 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 CARSP49589 748 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 DCDP81605 110 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 DR1Q01658 176 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 Q0VFX4 171 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 TRADDQ15628 312 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 IGFBP7Q16270 282 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 HKDC1Q2TB90 917 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 NADK2Q4G0N4 442 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 WASHC2DQ5SRD0 308 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 MLIPQ5VWP3 458 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 ICE2Q659A1 982 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 SBSNQ6UWP8 590 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 VN1R4Q7Z5H5 301 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 PCGF5Q86SE9 256 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 CTAGE6Q86UF2 777 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 LMNTD2Q8IXW0 634 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 AMER3Q8N944 861 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 SMPDL3AQ92484 453 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 INPP5DQ92835 1189 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 MIB2Q96AX9 1013 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 FKBP10Q96AY3 582 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 OR4K3Q96R72 315 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 KRT12Q99456 494 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 SELENOSQ9BQE4 189 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 FAM167BQ9BTA0 163 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 DPH7Q9BTV6 452 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 ING2Q9H160 280 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 SLC26A1Q9H2B4 701 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 SPNS1Q9H2V7 528 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 CUTCQ9NTM9 273 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 MOCS1Q9NZB8 636 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 ANKMY1Q9P2S6 941 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 TAC3Q9UHF0 121 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 ANAPC2Q9UJX6 822 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 COMMD10Q9Y6G5 202 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa5.05□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 A0A1W2PQ72 361 aa5.04□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 HYKKA2RU49 373 aa5.04□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 C9J4A7 227 aa5.04□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 MKRN2OSH3BPM6 223 aa5.04□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 CATP04040 527 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 ELANEP08246 267 aa5.04□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 AGXTP21549 392 aa5.04□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 OTX2P32243 289 aa5.04□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 SLC26A3P40879 764 aa5.04□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 CSRP3P50461 194 aa5.04□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 CCL11P51671 97 aa5.04□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 ARSFP54793 590 aa5.04□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 SOX8P57073 446 aa5.04□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 TAS2R39P59534 338 aa5.04□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 TBPL1P62380 186 aa5.04□□□□□ -1.6
CD46-211ENST00000464082 CSNK1G2P78368 415 aa5.04□□□□□ -1.6
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