RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TOR3AQ9H497 397 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 LTB4R2Q9NPC1 389 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 AHSPQ9NZD4 102 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFAF4Q9P032 175 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 NTMQ9P121 344 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 KCND3Q9UK17 655 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 RPS6KA6Q9UK32 745 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ACSL6Q9UKU0 697 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CEPT1Q9Y6K0 416 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 NINQ8N4C6 2090 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ADAMTS20P59510 1910 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PR48 441 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 FAM221BA6H8Z2 402 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PRR23AA6NEV1 266 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC72A6NJI9 287 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 A8MVJ9 347 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ISM1B1AKI9 464 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 M0QX08 132 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 OR1F1O43749 312 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CTSVO60911 334 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SEMA7AO75326 666 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GMNNO75496 209 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 JRKO75564 520 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 FKBP9O95302 570 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SEMA4FO95754 770 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 FABP3P05413 133 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ASGR2P07307 311 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 FESP07332 822 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 IFI6P09912 130 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 FUT4P22083 530 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PAX7P23759 505 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CRHBPP24387 322 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 XCR1P46094 333 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 LSSP48449 732 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 MAN2A2P49641 1150 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 DAPP51397 102 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CDH15P55291 814 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SRP54P61011 504 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 FUT5Q11128 374 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 EPS8Q12929 822 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 IL18R1Q13478 541 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 FZD2Q14332 565 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 RFX4Q33E94 735 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GCNT6Q5T4J0 391 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF691Q5VV52 312 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 AP1ARQ63HQ0 302 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA0895LQ68EN5 471 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 FCRL6Q6DN72 434 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 LAIR1Q6GTX8 287 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 FBXO42Q6P3S6 717 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SPESP1Q6UW49 350 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ISLR2Q6UXK2 745 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 AMIGO1Q86WK6 493 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 OFCC1Q8IZS5 231 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 HORMAD2Q8N7B1 307 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ACOT4Q8N9L9 421 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 OR13H1Q8NG92 308 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GPR32P1Q8NGA4 272 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CDC26Q8NHZ8 85 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 NFKBIDQ8NI38 313 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SFXN5Q8TD22 340 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GANCQ8TET4 914 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 NCLNQ969V3 563 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 OR2A5Q96R48 311 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
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