RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375726.6

CASP12-201, Transcript of caspase 12 (gene/pseudogene), humanhuman

APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP12, Length 1,306 nt, Biotype polymorphic pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12-201ENST00000375726 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 NDE1Q9NXR1 346 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 SLC39A1Q9NY26 324 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 CCDC167Q9P0B6 97 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 PISDQ9UG56 409 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 PSME2Q9UL46 239 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 A0A0A6YYD5 115 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 C1orf226A1L170 272 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 CCT8L1PA6NM43 557 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 C9J4A7 227 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 I3L1I5 382 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 M0R082 166 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 CLDN4O14493 209 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 PLD2O14939 933 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 ZNF749O43361 778 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 AKAP10O43572 662 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 EEDO75530 441 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 ATP5HO75947 161 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 LRATO95237 230 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 ALBP02768 609 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 IL6P05231 212 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 DRD2P14416 443 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 PIK3R1P27986 724 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 S100A3P33764 101 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 KIR3DL1P43629 444 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 GABRA4P48169 554 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 RASSF2P50749 326 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 PDX1P52945 283 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 MAPK10P53779 464 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 CLDN8P56748 225 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 RAB38P57729 211 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 SHC2P98077 582 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 MC2RQ01718 297 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 C2orf80Q0P641 193 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 HYAL2Q12891 473 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 KLF10Q13118 480 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 STX5Q13190 355 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 RCAN2Q14206 197 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 PGS1Q32NB8 556 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 TIGD2Q4W5G0 525 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 C3orf38Q5JPI3 329 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 MFSD4BQ5TF39 518 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 ANXA8L1Q5VT79 327 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 RHBDD2Q6NTF9 364 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 TMPRSS12Q86WS5 348 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 SNX32Q86XE0 403 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 DSELQ8IZU8 1212 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 NATD1Q8N6N6 113 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 C7orf57Q8NEG2 295 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 OR9A4Q8NGU2 314 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 C16orf78Q8WTQ4 265 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 TESCQ96BS2 214 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 KLHL29Q96CT2 875 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 SPDL1Q96EA4 605 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 C10orf90Q96M02 699 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 DDA1Q9BW61 102 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 MYLK2Q9H1R3 596 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 KLHL31Q9H511 634 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 ZNF385DQ9H6B1 395 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 REEP4Q9H6H4 257 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 FBXO8Q9NRD0 319 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 C14orf105Q9NVL8 296 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 EHD3Q9NZN3 535 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 HCN3Q9P1Z3 774 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 TAGLN3Q9UI15 199 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 FBXW2Q9UKT8 454 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 GPR45Q9Y5Y3 372 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 FRYLO94915 3013 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 ZNF292O60281 2723 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 SGK494L7N484 410 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 MRASO14807 208 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 NVLO15381 856 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 PDPK1O15530 556 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 HCRTR1O43613 425 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 TMPRSS11DO60235 418 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 BMP10O95393 424 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 ANP32DO95626 131 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 AIFM1O95831 613 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 ITGB2P05107 769 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CASP12-201ENST00000375726 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms