RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375391.5

TMCO3-201, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMCO3, Length 2,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3-201ENST00000375391 B4GALT2O60909 372 aa19.13■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 NME6O75414 186 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 NSA2O95478 260 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 IL6P05231 212 aa19.13■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 HPCAL1P37235 193 aa19.13■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 BTG2P78543 158 aa19.13■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 NDUFA9Q16795 377 aa19.13■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 VWA2Q5GFL6 755 aa19.13■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa19.13■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 PRDX6P30041 224 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 CASP9P55211 416 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 KCNJ2P63252 427 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 E2F1Q01094 437 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 TNFRSF17Q02223 184 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 ILKQ13418 452 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP19.12■□□□□ 0.651e-5■■■■□ 21.3
TMCO3-201ENST00000375391 MAPKAPK3Q16644 382 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 FAM214AQ32MH5 1076 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 TLDC1Q6P9B6 456 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 DLEU7Q6UYE1 221 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 RAB11FIP2Q7L804 512 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 RNF148Q8N7C7 305 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 OR51Q1Q8NH59 317 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 DNAJB14Q8TBM8 379 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 CMKLR1Q99788 373 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 RTKNQ9BST9 563 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 VAPAQ9P0L0 249 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 PISDQ9UG56 409 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 TGFBR3LH3BV60 316 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 FGF17O60258 216 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 C6orf47O95873 294 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 NR2F6P10588 404 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 XCR1P46094 333 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 C21orf58P58505 322 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 WLSQ5T9L3 541 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 GARNL3Q5VVW2 1013 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 LAPTM4BQ86VI4 370 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 MSRB3Q8IXL7 192 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 OR8J2Q8NGG1 315 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 CLIP3Q96DZ5 547 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 TXLNGQ9NUQ3 528 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 SLC39A1Q9NY26 324 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 CTSFQ9UBX1 484 aa19.12■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 SOX11P35716 441 aa19.11■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 ARFIP1P53367 373 aa19.11■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 LIMK1P53667 647 aa19.11■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 HBA1P69905 142 aa19.11■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP19.11■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 28.9
TMCO3-201ENST00000375391 STX5Q13190 355 aa19.11■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 SELPLGQ14242 412 aa19.11■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 C3orf38Q5JPI3 329 aa19.11■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 SLC48A1Q6P1K1 146 aa19.11■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 IKBIPQ70UQ0 350 aa19.11■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 CCDC116Q8IYX3 515 aa19.11■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 DEFB107AQ8IZN7 70 aa19.11■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 C10orf111Q8N326 155 aa19.11■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 SIMC1Q8NDZ2 872 aa19.11■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 COL26A1Q96A83 441 aa19.11■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 KLHL29Q96CT2 875 aa19.11■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 IKZF5Q9H5V7 419 aa19.11■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 CXorf56Q9H5V9 222 aa19.11■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 EFCAB1Q9HAE3 211 aa19.11■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 PIEZO1Q92508 2521 aa19.11■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 A0A088AWK7 358 aa19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 PTPN6P29350 595 aa19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 FOLH1Q04609 750 aa19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 ART3Q13508 389 aa19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 NFYCQ13952 458 aa19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 MAPRE2Q15555 327 aa19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 RABL3Q5HYI8 236 aa19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 ASRGL1Q7L266 308 aa19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 ADCY4Q8NFM4 1077 aa19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 GBP5Q96PP8 586 aa19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 TRPC4Q9UBN4 977 aa19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 A0A1B0GX78 115 aa19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 GYG2O15488 501 aa19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 PRMT3O60678 531 aa19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 MAOAP21397 527 aa19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 PPP2R1BP30154 601 aa19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 AVPR1BP47901 424 aa19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 MC2RQ01718 297 aa19.1■□□□□ 0.65
TMCO3-201ENST00000375391 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms