RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366391.6

SH3BP5-201, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-201ENST00000366391 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 VMP1Q96GC9 406 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 DEFB126Q9BYW3 111 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 VTI1BQ9UEU0 232 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF225Q9UK10 706 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 EMCNQ9ULC0 261 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 ATG4BQ9Y4P1 393 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 DNAJC13O75165 2243 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 A0A0A6YYD5 115 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 OR4F21O95013 312 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 SLU7O95391 586 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 CBX6O95503 412 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 IMPDH1P20839 514 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 CD96P40200 585 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 PRKAA2P54646 552 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 MLF1P58340 268 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 ID2Q02363 134 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 SERTAD2Q14140 314 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 INAQ16352 499 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 C18orf63Q68DL7 685 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 NUDT13Q86X67 352 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC22A9Q8IVM8 553 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 ARMC10Q8N2F6 343 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 MDS2Q8NDY4 140 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 FAR1Q8WVX9 515 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 NCLNQ969V3 563 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 L3HYPDHQ96EM0 354 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 TAAR6Q96RI8 345 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 ELOVL6Q9H5J4 265 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 ANKRD10Q9NXR5 420 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 TRPS1Q9UHF7 1281 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 ASB4Q9Y574 426 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 PCNX1Q96RV3 2341 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF407Q9C0G0 2248 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 PROM1O43490 865 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 TMPRSS11DO60235 418 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 FGF17O60258 216 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 CDH16O75309 829 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 OR1C1Q15619 314 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 SGO1Q5FBB7 561 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF766Q5HY98 468 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM219BQ5XKK7 198 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 CYP20A1Q6UW02 462 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM26EQ8N5C1 309 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 BCORP1Q8N888 145 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF382Q96SR6 550 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 SNX6Q9UNH7 406 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 HECTD1Q9ULT8 2610 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 ANKUB1A6NFN9 424 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 CDK2AP1O14519 115 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 PDYNP01213 254 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 PROCP04070 461 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM58BPP0C7Q3 252 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 TNNI3P19429 210 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 OR4N5Q8IXE1 308 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 MORN4Q8NDC4 146 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 C7orf57Q8NEG2 295 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 OR2W6PQ8NHA6 318 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 OR14A16Q8NHC5 309 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 SELENOMQ8WWX9 145 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 TANKQ92844 425 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 OLAHQ9NV23 265 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 V9GYY5 206 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 A0A1W2PR48 441 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 ESPNB1AK53 854 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 C17orf105B2RV13 164 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 G3V2L1 256 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 FCHO1O14526 889 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 RASAL1O95294 804 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 GBAP04062 536 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 NR2F6P10588 404 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 MYL2P10916 166 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP5-201ENST00000366391 EDN3P14138 238 aa17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms