RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC22A6Q4U2R8 563 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 AGAP6Q5VW22 663 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 RFWD3Q6PCD5 774 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 PODNL1Q6PEZ8 512 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 AQP12AQ8IXF9 295 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 SAMD12Q8N8I0 201 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATAD1Q8NBU5 361 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNRF1Q8ND25 227 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 GANCQ8TET4 914 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF414Q96IQ9 312 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF559Q9BR84 538 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLEK2Q9NYT0 353 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 VPS18Q9P253 973 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARMCX1Q9P291 453 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDH7Q9ULB5 785 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 CELA1Q9UNI1 258 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 POGZQ7Z3K3 1410 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM168BA1KXE4 195 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHUKO15111 745 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYT7O43581 403 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 C8orf89P0DMQ9 161 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ODC1P11926 461 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 EZRP15311 586 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALDH3B1P43353 468 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 BRCC3P46736 316 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 GSTO1P78417 241 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAAAQ02083 359 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGAP1Q07960 439 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 BFSP1Q12934 665 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRMP1Q14194 572 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 MARC1Q5VT66 337 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC38Q5VT99 294 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLRX5Q86SX6 157 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSCBQ8IWL3 235 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 C11orf42Q8N5U0 333 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC197Q8NCU1 140 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPATA18Q8TC71 538 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDHR1Q96JP9 859 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPATA17Q96L03 361 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB40CQ96S21 281 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 NT5DC2Q9H857 520 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABCB10Q9NRK6 738 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM161AQ9NX61 479 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 RSPH14Q9UHP6 348 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC6A5Q9Y345 797 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 UMODL1Q5DID0 1318 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A087X0K7 114 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAGEB16A2A368 324 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 SDR42E2A6NKP2 422 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 HAT1O14929 419 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 MCF2LO15068 1137 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP9AO75110 1047 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSO75390 466 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLCEO94923 617 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR6A2O95222 327 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 GH1P01241 217 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIGRP01833 764 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 GSTA2P09210 222 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 UMPSP11172 480 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLRA1P23415 457 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR1D2P34982 312 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 FRKP42685 505 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCR4P51679 360 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 IST1P53990 364 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 LYZP61626 148 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNPY1Q3B7I2 92 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 NHSL2Q5HYW2 709 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 UTF1Q5T230 341 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 SIAH3Q8IW03 269 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ICA1LQ8NDH6 482 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR7G3Q8NG95 312 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCP11Q8WWU5 503 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ESAMQ96AP7 390 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCED1BQ96HM7 432 aa2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms