RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 RAB5BP61020 215 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 SLC3A1Q07837 685 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 C16orf59Q7L2K0 433 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 SERPINA9Q86WD7 417 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.143e-7■■■□□ 17.6
PACS1-201ENST00000320580 LRRN3Q9H3W5 708 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 UBR3Q6ZT12 1888 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 OR2AT4A6NND4 320 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 IRAK2O43187 625 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 HLA-EP13747 358 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CD6P30203 668 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CBX5P45973 191 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 MAPKAPK2P49137 400 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 PGDP52209 483 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CLDN8P56748 225 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 HECTD3Q5T447 861 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 MEDAGQ5VYS4 303 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 PM20D1Q6GTS8 502 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 KRT78Q8N1N4 520 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 SAP130Q9H0E3 1048 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 RORAP35398 523 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 ZBTB6Q15916 424 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 C4orf46Q504U0 113 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 ZFP42Q96MM3 310 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 PTTG3PQ9NZH4 202 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 A0A1W2PQH9 124 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CD3GP09693 182 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 EBLN1P0CF75 366 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 MTFR2Q6P444 385 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 NLRP8Q86W28 1048 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 OSTM1Q86WC4 334 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 ZNF454Q8N9F8 522 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 OR7D4Q8NG98 312 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 OR52L1Q8NGH7 329 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 C1orf216Q8TAB5 229 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 EPYCQ99645 322 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 PIP5K1AQ99755 562 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 LIN7BQ9HAP6 207 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 SHOXO15266 292 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 GATBO75879 557 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 NCR1O76036 304 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 ACPPP15309 386 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 MANFP55145 182 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 MICAQ29983 383 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 IQCF1Q8N6M8 205 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 VNN3Q9NY84 501 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 LRP5O75197 1615 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 BMP7P18075 431 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 PTPN6P29350 595 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 TMEM207Q6UWW9 146 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 OR4K1Q8NGD4 311 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 OR6K2Q8NGY2 324 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 FANK1Q8TC84 345 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 TMEM159Q96B96 161 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 ACTR6Q9GZN1 396 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 IKZF5Q9H5V7 419 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 LGALS8O00214 317 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 PITPNM1O00562 1244 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 SOX9P48436 509 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 YBX1P67809 324 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CACNG1Q06432 222 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 FAM171A1Q5VUB5 890 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 FRG2Q64ET8 278 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 FAM171BQ6P995 826 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 ZMIZ2Q8NF64 920 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 REPS1Q96D71 796 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 FRG2BQ96QU4 278 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 ZIC5Q96T25 663 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 DPYSL5Q9BPU6 564 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 TMEM45AQ9NWC5 275 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 CLEC2DQ9UHP7 191 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 ZNF175Q9Y473 711 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 DAPL1A0PJW8 107 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 UPK1AO00322 258 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 SCG5P05408 212 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 ALPIP09923 528 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 JUPP14923 745 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 RFX3P48380 749 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-201ENST00000320580 ARFIP1P53367 373 aa15.92■□□□□ 0.14
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