RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 RD3Q7Z3Z2 195 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 ADCK1Q86TW2 530 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 NECTIN4Q96NY8 510 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 RIBC2Q9H4K1 309 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM118AQ9NWS6 357 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 BTNL2Q9UIR0 455 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 C3orf18Q9UK00 162 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAPRE3Q9UPY8 281 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR52A4PA6NMU1 304 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 H0YAE9 185 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR1F1O43749 312 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 MITFO75030 526 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 FGL2Q14314 439 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 COX20Q5RI15 118 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 CPZQ66K79 652 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR2T5Q6IEZ7 315 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 GALNT12Q8IXK2 581 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR2T29Q8NH02 315 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 VNN3Q9NY84 501 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 KIF17Q9P2E2 1029 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 ERVH48-1M5A8F1 160 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 VLDLRP98155 873 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 NPTX1Q15818 432 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 LCTLQ6UWM7 567 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 SZRD1Q7Z422 152 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 C5AR2Q9P296 337 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 M0R3G1 203 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 AQP6Q13520 282 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 THAP5Q7Z6K1 395 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 C11orf65Q8NCR3 313 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR52E4Q8NGH9 312 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 COQ8BQ96D53 544 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF304Q9HCX3 659 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 AHSPQ9NZD4 102 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 A0A1W2PRB8 838 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 SUV39H1O43463 412 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 DYRK3O43781 588 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAPK12P53778 367 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 CYP27C1Q4G0S4 372 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 HIPK1Q86Z02 1210 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 RAB42Q8N4Z0 105 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 LMAN2LQ9H0V9 348 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 SP140LQ9H930 580 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 FURINP09958 794 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 BMP4P12644 408 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 MEP1AQ16819 746 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 DESI1Q6ICB0 168 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 TUBA3EQ6PEY2 450 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 METTL4Q8N3J2 472 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 ATG16L2Q8NAA4 619 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 SMPDL3AQ92484 453 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 IL1RAPQ9NPH3 570 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 KCNN3Q9UGI6 736 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 PTGES3LE9PB15 166 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 TNFRSF1BP20333 461 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 PPIBP23284 216 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 IGFBP5P24593 272 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC9A3P48764 834 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCR8P51685 355 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLA2G16P53816 162 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 PCDH1Q08174 1060 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 WDR34Q96EX3 536 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC17A9Q9BYT1 436 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 CORO2BQ9UQ03 480 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 PIK3CBP42338 1070 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 CASP3P42574 277 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 RPS21P63220 83 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 IL5RAQ01344 420 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 CEP68Q76N32 757 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 PAGE2Q7Z2X7 111 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 RNF130Q86XS8 419 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC6A16Q9GZN6 736 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF221Q9UK13 617 aa19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM172BPA6NC97 362 aa19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms