RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635853.1

SPTAN1-228, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 5,870 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-228ENST00000635853 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 A0A1W2PPL8 197 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 B4GAT1O43505 415 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 ENTPD6O75354 484 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 ITGA10O75578 1167 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 S100A10P60903 97 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 GRIK2Q13002 908 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 KEAP1Q14145 624 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 UGT8Q16880 541 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 PGAP1Q75T13 922 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 OR7D4Q8NG98 312 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 SCGB3A2Q96PL1 93 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 C12orf57Q99622 126 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 ENAMQ9NRM1 1142 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 IL20Q9NYY1 176 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 BCL9LQ86UU0 1499 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 MEN1O00255 615 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 CSKP41240 450 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 NRIP1P48552 1158 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 C19orf57Q0VDD7 668 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 CYS1Q717R9 158 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 NARFLQ9H6Q4 476 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 PTGES2Q9H7Z7 377 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 SRRDQ9UH36 339 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 TIMM22Q9Y584 194 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 DIP2BQ9P265 1576 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 A0A1W2PRU2 124 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 MAGEB17A8MXT2 336 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 GPR89AB7ZAQ6 455 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 PDYNP01213 254 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 GPR89BP0CG08 455 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 EDNRAP25101 427 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 CDKN2CP42773 168 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 CRISP3P54108 245 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 PRKCZQ05513 592 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 FAM76BQ5HYJ3 339 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 GPRC6AQ5T6X5 926 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 NRARPQ7Z6K4 114 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 OR4C15Q8NGM1 316 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 MAPK15Q8TD08 544 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 ST8SIA2Q92186 375 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 ST8SIA4Q92187 359 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 SCLYQ96I15 445 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 ORAI3Q9BRQ5 295 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 RBCK1Q9BYM8 510 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 MAGEH1Q9H213 219 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 COQ4Q9Y3A0 265 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 FAM221BA6H8Z2 402 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 PPM1BO75688 479 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 GOT2P00505 430 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 H2AFB2P0C5Z0 115 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 MAGEA12P43365 314 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 CTBP2P56545 445 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 MC2RQ01718 297 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 ZNF460Q14592 562 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 PTGR1Q14914 329 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 GPR68Q15743 365 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 DECR1Q16698 335 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 YIPF4Q9BSR8 244 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 C1orf109Q9NX04 203 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 NLKQ9UBE8 527 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 ASB4Q9Y574 426 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 DIP2AQ14689 1571 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 A8MT66 165 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 LAMTOR5O43504 91 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 RPS17P08708 135 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 ITGAMP11215 1152 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 POU2F1P14859 743 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 DDCP20711 480 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 TMPPEQ6ZT21 453 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 OR10G2Q8NGC3 310 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 OR5B17Q8NGF7 314 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 TMEM74Q96NL1 305 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 CSPG4P5Q96PW8 444 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 CIB4A0PJX0 185 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms