RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 TUBA3EQ6PEY2 450 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 FIGLAQ6QHK4 219 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PAQR9Q6ZVX9 377 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 DET1Q7L5Y6 550 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 BNIPLQ7Z465 357 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC26A11Q86WA9 606 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 VRK3Q8IV63 474 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CTAGE3PQ8IX95 158 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 C4orf33Q8N1A6 199 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 THEM5Q8N1Q8 247 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC110Q8TBZ0 833 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC8CQ8TDW0 803 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 DCAKDQ8WVC6 231 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC44A1Q8WWI5 657 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 IRGQQ8WZA9 623 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CDKL2Q92772 493 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 NT5C3BQ969T7 300 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 MYLPFQ96A32 169 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 MIB2Q96AX9 1013 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 EME1Q96AY2 570 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 MTBPQ96DY7 904 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CFAP36Q96G28 342 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PCED1BQ96HM7 432 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SPATA13Q96N96 652 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 OLFM3Q96PB7 478 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PKP4Q99569 1192 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 GFI1Q99684 422 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ACBD6Q9BR61 282 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 NAT9Q9BTE0 207 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PITPNM3Q9BZ71 974 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 C1orf21Q9H246 121 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 RAD21L1Q9H4I0 556 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 COX16Q9P0S2 106 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 STK39Q9UEW8 545 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ACSL5Q9ULC5 683 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PADI3Q9ULW8 664 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SQORQ9Y6N5 450 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 VWA8A3KMH1 1905 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 MYLKQ15746 1914 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 FEZF1A0PJY2 475 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 MYBPHLA2RUH7 354 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CFAP73A6NFT4 308 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 YJEFN3A6XGL0 299 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 HEPACAM2A8MVW5 462 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 E7ENQ6 273 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 STMND1H3BQB6 276 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 K7ESM1 405 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 KIR2DS3K7RE56 304 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF103O00237 685 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 COPEO14579 308 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 NDUFS4O43181 175 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TXNL1O43396 289 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 EDF1O60869 148 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 DCTN3O75935 186 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 B3GAT3O94766 335 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 GUCA1CO95843 209 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 RLN1P04808 185 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 NEFHP12036 1026 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PGAM1P18669 254 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ITIH1P19827 911 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TYMPP19971 482 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TAC1P20366 129 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 MYF6P23409 242 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CD27P26842 260 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 HOXD10P28358 340 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ALDH3A1P30838 453 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SOAT1P35610 550 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PIGAP37287 484 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 MAGEA3P43357 314 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 HCAR3P49019 387 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 COG7P83436 770 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PRKCZQ05513 592 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC20A2Q08357 652 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 DNAJC3Q13217 504 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 DPYSQ14117 519 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 MEP1AQ16819 746 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 UPP1Q16831 310 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 LCN10Q6JVE6 187 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC8BQ6P9F7 803 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 UNC5DQ6UXZ4 953 aa3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms