RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 PHF21BQ96EK2 531 aa18.02■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTCHD1Q96NR3 888 aa18.02■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 QRFPRQ96P65 431 aa18.02■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 XPR1Q9UBH6 696 aa18.02■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF835Q9Y2P0 537 aa18.02■□□□□ 0.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 DNHD1Q96M86 4753 aa18.01■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC189A1A4V9 331 aa18.01■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAGEB17A8MXT2 336 aa18.01■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
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CD27-AS1-208ENST00000538616 OR4D2P58180 307 aa18.01■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 GTF2H2Q13888 395 aa18.01■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP18.01■□□□□ 0.474e-8■■■□□ 15.9
CD27-AS1-208ENST00000538616 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa18.01■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 MED27Q6P2C8 311 aa18.01■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRIM40Q6P9F5 258 aa18.01■□□□□ 0.47
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CD27-AS1-208ENST00000538616 SPPL2CQ8IUH8 684 aa18.01■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 SEC16BQ96JE7 1060 aa18.01■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 SAP18O00422 153 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 RTCAO00442 366 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
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CD27-AS1-208ENST00000538616 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 ST13P50502 369 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 PCDH1Q08174 1060 aa18■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 FCRLBQ6BAA4 426 aa18■□□□□ 0.47
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CD27-AS1-208ENST00000538616 GRHL2Q6ISB3 625 aa18■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 ABHD17CQ6PCB6 329 aa18■□□□□ 0.47
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CD27-AS1-208ENST00000538616 LAS2Q8IYD9 372 aa18■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 CYP4X1Q8N118 509 aa18■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 EID3Q8N140 333 aa18■□□□□ 0.47
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CD27-AS1-208ENST00000538616 MS4A8Q9BY19 250 aa18■□□□□ 0.47
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CD27-AS1-208ENST00000538616 A8MUI8 341 aa17.99■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 FOXO6A8MYZ6 492 aa17.99■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 B3GALT2O43825 422 aa17.99■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 COL6A2P12110 1019 aa17.99■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 ICAM2P13598 275 aa17.99■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa17.99■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 QSOX2Q6ZRP7 698 aa17.99■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa17.99■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM47BQ8NA70 645 aa17.99■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 OR51B5Q9H339 312 aa17.99■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 ACTR8Q9H981 624 aa17.99■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 RNF11Q9Y3C5 154 aa17.99■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 SBK3P0C264 359 aa17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 PIK3CGP48736 1102 aa17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 LIM2P55344 173 aa17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 RAB38P57729 211 aa17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 PPP2R2AP63151 447 aa17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 LGSNQ5TDP6 509 aa17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 ABHD17BQ5VST6 288 aa17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF793Q6ZN11 406 aa17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 HUS1BQ8NHY5 278 aa17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 UBE2E3Q969T4 207 aa17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDK15Q96Q40 435 aa17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 SERINC2Q96SA4 455 aa17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 CSF3RQ99062 836 aa17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 LPAR4Q99677 370 aa17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 KCNK13Q9HB14 408 aa17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRDM9Q9NQV7 894 aa17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 TBK1Q9UHD2 729 aa17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 TEKT2Q9UIF3 430 aa17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa17.98■□□□□ 0.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
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