RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	ALG6	Q9Y672	507 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MYH10	P35580	1976 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TSHB	P01222	138 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	KRT5	P13647	590 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CYP2B6	P20813	491 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CHRNB4	P30926	498 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	HOXC8	P31273	242 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	RAB28	P51157	221 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	HERV-K104	P61576	105 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	RALGDS	Q12967	914 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TAF3	Q5VWG9	929 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PEX26	Q7Z412	305 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	NUDT13	Q86X67	352 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CD302	Q8IX05	232 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	NME8	Q8N427	588 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	NR4A3	Q92570	626 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PSMB7	Q99436	277 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PELI2	Q9HAT8	420 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	GKN1	Q9NS71	199 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MCM3AP	O60318	1980 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CALCA	P01258	141 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TNNC2	P02585	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	DNTT	P04053	509 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CXCL8	P10145	99 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CA6	P23280	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	AXL	P30530	894 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	OSTN	P61366	133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	VSNL1	P62760	191 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	C2orf54	Q08AI8	447 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	DMPK	Q09013	629 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	XKR4	Q5GH76	650 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	DCAF10	Q5QP82	559 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM270	Q6UE05	265 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TLK2	Q86UE8	772 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CDK20	Q8IZL9	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TRPV1	Q8NER1	839 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CPB2	Q96IY4	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CARD9	Q9H257	536 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	LHX5	Q9H2C1	402 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	CISH	Q9NSE2	258 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS13-208	ENST00000531908	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms