RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 STK38Q15208 465 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRK-220ENST00000531466 HADHQ16836 314 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
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PTPRK-220ENST00000531466 LRIT3Q3SXY7 679 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRK-220ENST00000531466 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
PTPRK-220ENST00000531466 TCP11X2Q5H9J9 407 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRK-220ENST00000531466 EXT1Q16394 746 aa3.12□□□□□ -1.91
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PTPRK-220ENST00000531466 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRK-220ENST00000531466 PSKH2Q96QS6 385 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRK-220ENST00000531466 PLIN2Q99541 437 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRK-220ENST00000531466 FUT8Q9BYC5 575 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRK-220ENST00000531466 HAUS4Q9H6D7 363 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRK-220ENST00000531466 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRK-220ENST00000531466 PFDN4Q9NQP4 134 aa3.12□□□□□ -1.91
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