RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 SSR2P43308 183 aa15.9■□□□□ 0.14
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PACS1-208ENST00000529677 I3L1I5 382 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PACS1-208ENST00000529677 B3GALT4O96024 378 aa15.88■□□□□ 0.13
PACS1-208ENST00000529677 PCSK2P16519 638 aa15.88■□□□□ 0.13
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PACS1-208ENST00000529677 CERS1P27544 350 aa15.88■□□□□ 0.13
PACS1-208ENST00000529677 CD82P27701 267 aa15.88■□□□□ 0.13
PACS1-208ENST00000529677 MAPK1P28482 360 aa15.88■□□□□ 0.13
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PACS1-208ENST00000529677 TMEM164Q5U3C3 297 aa15.88■□□□□ 0.13
PACS1-208ENST00000529677 NOXRED1Q6NXP6 359 aa15.88■□□□□ 0.13
PACS1-208ENST00000529677 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PACS1-208ENST00000529677 MED25Q71SY5 747 aa15.88■□□□□ 0.13
PACS1-208ENST00000529677 AMER3Q8N944 861 aa15.88■□□□□ 0.13
PACS1-208ENST00000529677 OR9A4Q8NGU2 314 aa15.88■□□□□ 0.13
PACS1-208ENST00000529677 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
PACS1-208ENST00000529677 CCT8L2Q96SF2 557 aa15.88■□□□□ 0.13
PACS1-208ENST00000529677 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
PACS1-208ENST00000529677 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PACS1-208ENST00000529677 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PACS1-208ENST00000529677 LYRM4Q9HD34 91 aa15.88■□□□□ 0.13
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