RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	SVIL	O95425	2214 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	COPE	O14579	308 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLIN3	O60664	434 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	DPM1	O60762	260 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	SCEL	O95171	688 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	OTC	P00480	354 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	SSR2	P43308	183 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR4D2	P58180	307 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	BTBD16	Q32M84	506 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	SGO1	Q5FBB7	561 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	FRG2	Q64ET8	278 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	AGAP4	Q96P64	663 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	FRG2B	Q96QU4	278 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325		A8MUA0	341 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	KLHL41	O60662	606 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ALPP	P05187	535 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	MYL2	P10916	166 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	BSG	P35613	385 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	RAP1GDS1	P52306	607 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PHEX	P78562	749 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLAMF1	Q13291	335 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	CUL3	Q13618	768 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCDC153	Q494R4	210 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC6A19	Q695T7	634 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325		Q8NA96	180 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	LYRM4	Q9HD34	91 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ITPR3	Q14573	2671 aa		14.83	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	EED	O75530	441 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	PDYN	P01213	254 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ICAM2	P13598	275 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	CREB1	P16220	341 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	PPP2R1B	P30154	601 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	SOX11	P35716	441 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC26A5	P58743	744 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC13A2	Q13183	592 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	HPS6	Q86YV9	775 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	BANP	Q8N9N5	519 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZBTB9	Q96C00	473 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF382	Q96SR6	550 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	LPAR4	Q99677	370 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	PPT2	Q9UMR5	302 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325		A0A0A6YYD5	115 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLDN4	O14493	209 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMPRSS11D	O60235	418 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	CTNS	O60931	367 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	LDB3	O75112	727 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	SPAG7	O75391	227 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	GBA	P04062	536 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRF1	P14222	555 aa		14.82	□□□□□ -0.04

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