RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 SLC12A2P55011 1212 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 RAB10P61026 200 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SLC18A2Q05940 514 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ADNP2Q6IQ32 1131 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 XKRXQ6PP77 449 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 DOLPP1Q86YN1 238 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 LGI4Q8N135 537 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 C4orf33Q8N1A6 199 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 HORMAD2Q8N7B1 307 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 APCDD1LQ8NCL9 501 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TRPV3Q8NET8 790 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ACMSDQ8TDX5 336 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TSPAN17Q96FV3 270 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 DEFB126Q9BYW3 111 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TRIM8Q9BZR9 551 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 CHST11Q9NPF2 352 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 FAM53CQ9NYF3 392 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SENP1Q9P0U3 644 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 OARD1Q9Y530 152 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ASB1Q9Y576 335 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ACTL7BQ9Y614 415 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 POLQO75417 2590 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 EML6Q6ZMW3 1958 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 A0A096LPK6 155 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 URADA6NGE7 173 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 PRAMEF4O60810 478 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SERPINA6P08185 405 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 KRT4P19013 534 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 CRABP2P29373 138 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 MEOX1P50221 254 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 HLCSP50747 726 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SMSP52788 366 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 GPR85P60893 370 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SKP1P63208 163 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 IRF9Q00978 393 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 HSP90B2PQ58FF3 399 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 GDF7Q7Z4P5 450 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 MDGA2Q7Z553 956 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 GHDCQ8N2G8 530 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 BANPQ8N9N5 519 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 FAM47BQ8NA70 645 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 CCT6BQ92526 530 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ESAMQ96AP7 390 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 RHBDF1Q96CC6 855 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 LURAP1Q96LR2 239 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 VPS11Q9H270 941 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 POPDC3Q9HBV1 291 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 FBXW2Q9UKT8 454 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 CLDN16Q9Y5I7 305 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 HRH3Q9Y5N1 445 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 KCNE2Q9Y6J6 123 aa11.78□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TAPBPO15533 448 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 ERI3O43414 337 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 SPAG7O75391 227 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 CLDN14O95500 239 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 MLYCDO95822 493 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 PTGER4P35408 488 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 SLC6A12P48065 614 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 PLA2G16P53816 162 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP10-9P60411 292 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 CDKL1Q00532 357 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 DLG1Q12959 904 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 NIPAL1Q6NVV3 410 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 RAPH1Q70E73 1250 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 FRA10AC1Q70Z53 315 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 VN1R5Q7Z5H4 357 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 CLNKQ7Z7G1 428 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 SULF2Q8IWU5 870 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 SCUBE1Q8IWY4 988 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 B3GNT7Q8NFL0 401 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 KCTD4Q8WVF5 259 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 NCLNQ969V3 563 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 GAL3ST3Q96A11 431 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 MS4A6EQ96DS6 147 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 APOPT1Q96IL0 206 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 QRFPRQ96P65 431 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 SMC6Q96SB8 1091 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 CSF3RQ99062 836 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-212ENST00000485532 TMEM79Q9BSE2 394 aa11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms