RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 UBE2E3Q969T4 207 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 RELTQ969Z4 430 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 KIAA1191Q96A73 305 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SMIM10Q96HG1 83 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 FRMD6Q96NE9 622 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 KCNC2Q96PR1 638 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CENPKQ9BS16 269 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC1Q9BTT6 524 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ACTR8Q9H981 624 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ADAP2Q9NPF8 381 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 HPF1Q9NWY4 346 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 COPS7AQ9UBW8 275 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ASB1Q9Y576 335 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 IKBKGQ9Y6K9 419 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 FBN2P35556 2912 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1B0GTH9 108 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC14BA6NHZ5 514 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 SYCE1LA8MT33 242 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 K7EPI3 171 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 PRAMEF4O60810 478 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 CTNSO60931 367 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 KERAO60938 352 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 ACSL3O95573 720 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 SLC35E2BP0CK96 405 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 COX7A2P14406 83 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 CD22P20273 847 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 PHBP35232 272 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 SOX3P41225 446 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 SLAMF1Q13291 335 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 SGO1Q5FBB7 561 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 TEX35Q5T0J7 233 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 KLC3Q6P597 504 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 CYP20A1Q6UW02 462 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 ZDHHC24Q6UX98 284 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 CEP128Q6ZU80 1094 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 MDGA2Q7Z553 956 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 ISCA2Q86U28 154 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF595Q8IYB9 648 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 LGI4Q8N135 537 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF321PQ8N8H1 164 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 ACOT4Q8N9L9 421 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 PDPRQ8NCN5 879 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 AGAP11Q8TF27 550 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 CMTM7Q96FZ5 175 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 SCMH1Q96GD3 660 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 QRFPRQ96P65 431 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 DGAT2Q96PD7 388 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 TBCDQ9BTW9 1192 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 ROGDIQ9GZN7 287 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 EXO5Q9H790 373 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 NT5DC2Q9H857 520 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 SNX15Q9NRS6 342 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 PPT2Q9UMR5 302 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 DAPP1Q9UN19 280 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 ITPR3Q14573 2671 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 A0A087X1B8 175 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 A0A096LPK6 155 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 GLOD5A6NK44 160 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 DYRK3O43781 588 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 OR10H2O60403 315 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 OR6B1O95007 311 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 GBAP04062 536 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 TUBB4AP04350 444 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 C2P06681 752 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 INHBAP08476 426 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 PRF1P14222 555 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 GSTM2P28161 218 aa7.51□□□□□ -1.21
CTPS1-209ENST00000480420 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms