RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 NDUFAF1Q9Y375 327 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCM1Q15154 2024 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 C9JVG2 144 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYR61O00622 381 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANGPT2O15123 496 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP5HO75947 161 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 TIAF1O95411 115 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 CBX6O95503 412 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAPN3P20807 821 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL10P22301 178 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ALDH9A1P49189 494 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 OLR1P78380 273 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABHD18Q0P651 414 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC74AQ0VAA2 488 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 BNIP1Q12981 228 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 VPS26BQ4G0F5 336 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 TIGD2Q4W5G0 525 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANXA8L1Q5VT79 327 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR52E8Q6IFG1 317 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC48A1Q6P1K1 146 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 MED25Q71SY5 747 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 GALNT15Q8N3T1 639 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 POU5F2Q8N7G0 328 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 VPS37AQ8NEZ2 397 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC45A3Q96JT2 553 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRFN5Q96NI6 719 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 DUSP26Q9BV47 211 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 RMND5AQ9H871 391 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 HCN3Q9P1Z3 774 aa16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAJB6O75190 326 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ONECUT2O95948 504 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 T-ENOLP0DO92 83 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD1EP15812 388 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ITIH1P19827 911 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBLP22087 321 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 DGKQP52824 942 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 SHC2P98077 582 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 MMEL1Q495T6 779 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM164Q5U3C3 297 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 C18orf63Q68DL7 685 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 MMP21Q8N119 569 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 DTWD1Q8N5C7 304 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR51Q1Q8NH59 317 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 TANKQ92844 425 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 COL26A1Q96A83 441 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 VPS33AQ96AX1 596 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 GBP5Q96PP8 586 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR1F2PQ96R84 312 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR52E6Q96RD3 313 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 B3GNT4Q9C0J1 378 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 EFCAB1Q9HAE3 211 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 PISDQ9UG56 409 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 CES1P1Q9UKY3 287 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAU2Q9Y6X3 613 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIAA0754O94854 1291 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 UNC5CO95185 931 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 NTRK1P04629 796 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 LAMP1P11279 417 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 RORAP35398 523 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR1D4P47884 311 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 RASSF2P50749 326 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAPK10P53779 464 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCDP81605 110 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGAP40Q5TG30 622 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 C1orf189Q5VU69 101 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR4F3Q6IEY1 312 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF595Q8IYB9 648 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM47BQ8NA70 645 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC38A9Q8NBW4 561 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAJB8Q8NHS0 232 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUDT8Q8WV74 236 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBC1D20Q96BZ9 403 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 CSF3RQ99062 836 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ULBP3Q9BZM4 244 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 UTS2RQ9UKP6 389 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBP2O00757 339 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLDN4O14493 209 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 PGRMC2O15173 223 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPPAP01160 153 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms