RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 CASC4Q6P4E1 433 aa17.76■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 OPN5Q6U736 354 aa17.76■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 RAD9BQ6WBX8 426 aa17.76■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 PALM2Q8IXS6 379 aa17.76■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 FAM47BQ8NA70 645 aa17.76■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 NEIL3Q8TAT5 605 aa17.76■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 SLC5A11Q8WWX8 675 aa17.76■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 TSNARE1Q96NA8 513 aa17.76■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 TSGA10Q9BZW7 698 aa17.76■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 COMMD10Q9Y6G5 202 aa17.76■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa17.76■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 AHRRA9YTQ3 701 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 CLDN4O14493 209 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 IL2RAP01589 272 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 IFNA16P05015 189 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 SERPINA6P08185 405 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 TPSB2P20231 275 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 HIST1H2ADP20671 130 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 RAB38P57729 211 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 SORDQ00796 357 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 TPSAB1Q15661 275 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 SEL1L2Q5TEA6 688 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 UGT3A1Q6NUS8 523 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 MORN4Q8NDC4 146 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF592Q92610 1267 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 HIST1H2AJQ99878 128 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 H2AFJQ9BTM1 129 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 BDH2Q9BUT1 245 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 OR8D2Q9GZM6 311 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 ACKR4Q9NPB9 350 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 SAT1P21673 171 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 RGS4P49798 205 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 PRAMEF20Q5VT98 475 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 SLC22A10Q63ZE4 541 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 PAQR3Q6TCH7 311 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 C4orf22Q6V702 233 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 LACC1Q8IV20 430 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 MYO1HQ8N1T3 1032 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 LIX1Q8N485 282 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 NDNQ99608 321 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 PROK2Q9HC23 129 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 SH2D2AQ9NP31 389 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 ZFP64Q9NPA5 681 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 ARL15Q9NXU5 204 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 TRPS1Q9UHF7 1281 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 FREM3P0C091 2139 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM64A6NGJ6 449 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM64BA6NI03 449 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC3CA6NJW4 275 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 SMPD2O60906 423 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 CDK16Q00536 496 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 BBS9Q3SYG4 887 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 CAPN12Q6ZSI9 719 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF595Q8IYB9 648 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 OR8K3Q8NH51 312 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 LINGO1Q96FE5 620 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 FAR2Q96K12 515 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 CSF3RQ99062 836 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 AIF1LQ9BQI0 150 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 PELI2Q9HAT8 420 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 JKAMPQ9P055 326 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 VTI1BQ9UEU0 232 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 FBXO5Q9UKT4 447 aa17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 HIVEP2P31629 2446 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 ZANQ9Y493 2812 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 GUCA1CO95843 209 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 TNNI3P19429 210 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 KCNJ1P48048 391 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 KCNJ2P63252 427 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 ASPHQ12797 758 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 DUSP8Q13202 625 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 CCNG2Q16589 344 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 PIGGQ5H8A4 983 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 NXPE4Q6UWF7 544 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 TMPRSS11BQ86T26 416 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA1328Q86T90 577 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXD12-201ENST00000404162 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.8 ms