RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 MED27Q6P2C8 311 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ABHD17CQ6PCB6 329 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF595Q8IYB9 648 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 LAS2Q8IYD9 372 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 LGI4Q8N135 537 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 KIF2BQ8N4N8 673 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TEX9Q8N6V9 391 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM52Q8NDY8 209 aa7.17□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 NR4A3Q92570 626 aa7.17□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa7.17□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD10Q9NXR5 420 aa7.17□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa7.16□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 A8MUA0 341 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa7.16□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 SH3BGRLO75368 114 aa7.16□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 CLNKQ7Z7G1 428 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 RETREG3Q86VR2 466 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 MDS2Q8NDY4 140 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 CMTM7Q96FZ5 175 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 C5orf34Q96MH7 638 aa7.16□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 DEFB126Q9BYW3 111 aa7.16□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 ACTR8Q9H981 624 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 LYRM4Q9HD34 91 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ADAP2Q9NPF8 381 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 DMRT3Q9NQL9 472 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL1Q9NR64 748 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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