RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269886.7

SH3GL1-201, Transcript of SH3 domain containing GRB2 like 1, endophilin A2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3GL1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1-201ENST00000269886 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 AMER2Q8N7J2 671 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 OR5AR1Q8NGP9 310 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 ARRDC3Q96B67 414 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 ASF1AQ9Y294 204 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 C6P13671 934 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 CNR2P34972 360 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 CDC42P60953 191 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 ST8SIA6P61647 398 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 DOC2BQ14184 412 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 FBXO43Q4G163 708 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 TPRG1LQ5T0D9 272 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 SLC9B2Q86UD5 537 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 TAGAPQ8N103 731 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 HORMAD2Q8N7B1 307 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 HTRA1Q92743 480 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 NLNQ9BYT8 704 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 QPCTLQ9NXS2 382 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 C5AR2Q9P296 337 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 FTSJ1Q9UET6 329 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 PAPLNO95428 1278 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 UQCRC2P22695 453 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 TEKQ02763 1124 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 MED22Q15528 200 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 REEP3Q6NUK4 255 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 PTCHD4Q6ZW05 846 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 NXPE3Q969Y0 559 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 PLPP1O14494 284 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 KDM1AO60341 852 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 DNTTP04053 509 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 BCHEP06276 602 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 STEAP3Q658P3 488 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 FRMPD2BQ6IN97 320 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 UNC5DQ6UXZ4 953 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 SLC38A5Q8WUX1 472 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 ZAR1LA6NP61 321 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 ZW10O43264 779 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 PI15O43692 258 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 CYP17A1P05093 508 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 ALDH9A1P49189 494 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 LIMK1P53667 647 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 CRISP1P54107 249 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 RAB8BQ92930 207 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 NINQ8N4C6 2090 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 TP53BP2Q13625 1128 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 FAM129CQ86XR2 697 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 CLIP4Q8N3C7 705 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 KBTBD8Q8NFY9 601 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 F2RL3Q96RI0 385 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 IL4I1Q96RQ9 567 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 ANKDD1BA6NHY2 528 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 PRRT4C9JH25 899 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 TAF4O00268 1085 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 IKBIPQ70UQ0 350 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 OR2L2Q8NH16 312 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 UBE2E3Q969T4 207 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 PDXPQ96GD0 296 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 CRELD1Q96HD1 420 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 ICKQ9UPZ9 632 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 SEMA7AO75326 666 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 PRNPP04156 253 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 MAGP20916 626 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 FEN1P39748 380 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 TSTQ16762 297 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 C11orf96Q7Z7L8 435 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 LACC1Q8IV20 430 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 PARP16Q8N5Y8 322 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 GPR32P1Q8NGA4 272 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 MGLLQ99685 303 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.89■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 FGF19O95750 216 aa22.89■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 ADH5P11766 374 aa22.89■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa22.89■■□□□ 1.26
SH3GL1-201ENST00000269886 POC5Q8NA72 575 aa22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms