RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 TUBA1BP68363 451 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 PIGFQ07326 219 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC20Q12834 499 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 RAPSNQ13702 412 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ADPRMQ3LIE5 342 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 TTLL9Q3SXZ7 439 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 TUBA1AQ71U36 451 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 DET1Q7L5Y6 550 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFP90Q8TF47 636 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 CD244Q9BZW8 370 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 IKZF5Q9H5V7 419 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SP140LQ9H930 580 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 CPNE5Q9HCH3 593 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 CLDN24A6NM45 220 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFRSF10CO14798 259 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFP01375 233 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 PRPS2P11908 318 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 FCGR1BQ92637 280 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 USP7Q93009 1102 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ASXL3Q9C0F0 2248 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 AK4P27144 223 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 NFATC2Q13469 925 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 BCL2A1Q16548 175 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 GPRC6AQ5T6X5 926 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 KDM4DQ6B0I6 523 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS35Q96QK1 796 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 TBCDQ9BTW9 1192 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 RDH14Q9HBH5 336 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKMY1Q9P2S6 941 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ASPMQ8IZT6 3477 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SAGE2PA6NJ88 616 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BM21 787 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 YY2O15391 372 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 RGS10O43665 173 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC22BO75396 215 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM16O95361 564 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 CTSEP14091 401 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP5CP53041 499 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 CLDN8P56748 225 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 CLCA4Q14CN2 919 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 CDKL4Q5MAI5 379 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 SNX20Q7Z614 316 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 NRROSQ86YC3 692 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 CADM3Q8N126 398 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM39Q9HCM9 518 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 ERVK-18Q9QC07 812 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 GPSM3Q9Y4H4 160 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 A3GALT2U3KPV4 340 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa25.14■■□□□ 1.61
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CAPNS1-201ENST00000246533 PERM1Q5SV97 790 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2T5Q6IEZ7 315 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 BTLAQ7Z6A9 289 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2T29Q8NH02 315 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 CNIH3Q8TBE1 160 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM165Q9HC07 324 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 SPASTQ9UBP0 616 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS6KA6Q9UK32 745 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 MANBAO00462 879 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 YKT6O15498 198 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 DPM1O60762 260 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT6AP02538 564 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 FTH1P02794 183 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT6BP04259 564 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 BMP4P12644 408 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 ACPPP15309 386 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKACGP22612 351 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 MAPK1P28482 360 aa25.12■■□□□ 1.61
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CAPNS1-201ENST00000246533 S100A3P33764 101 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 GRK6P43250 576 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT6CP48668 564 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPA7P48741 367 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 BLKP51451 505 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 ABRQ12979 859 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 PAGE2BQ5JRK9 111 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINA11Q86U17 422 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 RHOXF1Q8NHV9 184 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 TESCQ96BS2 214 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 HBEGFQ99075 208 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 IL1RAPQ9NPH3 570 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 GMPPBQ9Y5P6 360 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD12Q6UB98 2062 aa25.12■■□□□ 1.61
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