RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CHUK	O15111	745 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	STBD1	O95210	358 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SERPINB2	P05120	415 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	NUDT17	P0C025	328 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SBK2	P0C263	348 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	THEGL	P0DJG4	465 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SKIL	P12757	684 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ATP6V1B1	P15313	513 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	AOC1	P19801	751 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CYP3A5	P20815	502 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	GLRA1	P23415	457 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	PKLR	P30613	574 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	FCGR2C	P31995	323 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	FHIT	P49789	147 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	UCP2	P55851	309 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	GABPA	Q06546	454 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	TEF	Q10587	303 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	RIG	Q13278	110 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SPHAR	Q15513	63 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM64	Q6YI46	380 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	PHC2	Q8IXK0	858 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ELMOD1	Q8N336	334 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175		Q8N377	158 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	TRPV3	Q8NET8	790 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SPATA18	Q8TC71	538 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	GPR148	Q8TDV2	347 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	FAM46B	Q96A09	425 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ULK4	Q96C45	1275 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	C5orf30	Q96GV9	206 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CABS1	Q96KC9	395 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	IWS1	Q96ST2	819 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	S1PR3	Q99500	378 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	VGLL1	Q99990	258 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	NTMT1	Q9BV86	223 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	LRRC61	Q9BV99	259 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	TRIM15	Q9C019	465 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	KCNK6	Q9Y257	313 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CACNA1F	O60840	1977 aa		2.54	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175		K7EQG2	157 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CCS	O14618	274 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	INPP4B	O15327	924 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CPNE6	O95741	557 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	OLFM2	O95897	454 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	PRELP	P51888	382 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	GCKR	Q14397	625 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF146	Q15072	292 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	HFE	Q30201	348 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	NEPRO	Q6NW34	567 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	C17orf64	Q86WR6	236 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	FAM131B	Q86XD5	332 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	GANC	Q8TET4	914 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	LIPH	Q8WWY8	451 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	KRT35	Q92764	455 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	HAS2	Q92819	552 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	MED17	Q9NVC6	651 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		2.53	□□□□□ -2
ATRX-223	ENST00000637175	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		2.52	□□□□□ -2.01
ATRX-223	ENST00000637175	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		2.52	□□□□□ -2.01
ATRX-223	ENST00000637175		E9PQ18	207 aa		2.52	□□□□□ -2.01
ATRX-223	ENST00000637175	PSMD3	O43242	534 aa		2.52	□□□□□ -2.01

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