RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 CTBP1Q13363 440 aa20.14■□□□□ 0.81
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CAPNS1-205ENST00000588780 ABHD11Q8NFV4 315 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-205ENST00000588780 FAR2Q96K12 515 aa20.14■□□□□ 0.81
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CAPNS1-205ENST00000588780 PARVBQ9HBI1 364 aa20.14■□□□□ 0.81
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CAPNS1-205ENST00000588780 KLHL31Q9H511 634 aa20.13■□□□□ 0.81
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CAPNS1-205ENST00000588780 HSD17B7P56937 341 aa20.1■□□□□ 0.81
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CAPNS1-205ENST00000588780 SCUBE1Q8IWY4 988 aa20.1■□□□□ 0.81
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CAPNS1-205ENST00000588780 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
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