RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587655.2

SBNO2-205, Transcript of strawberry notch homolog 2, humanhuman

TSL 3

Gene SBNO2, Length 914 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2-205ENST00000587655 GOLM1Q8NBJ4 401 aa14.5□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 TRPV3Q8NET8 790 aa14.5□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa14.5□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 SCYL1Q96KG9 808 aa14.5□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 OR4K3Q96R72 315 aa14.5□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 KLHL31Q9H511 634 aa14.5□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 EXO5Q9H790 373 aa14.5□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 SACM1LQ9NTJ5 587 aa14.5□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 SPRR3Q9UBC9 169 aa14.5□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 CLDN16Q9Y5I7 305 aa14.5□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 CTAGE15A4D2H0 777 aa14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 CD53P19397 219 aa14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 HIST1H2ADP20671 130 aa14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 DNASE1L1P49184 302 aa14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 HSD17B7P56937 341 aa14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 BMPR2Q13873 1038 aa14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 CSHL1Q14406 222 aa14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 41.5
SBNO2-205ENST00000587655 BBS9Q3SYG4 887 aa14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 DUPD1Q68J44 220 aa14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 HSDL2Q6YN16 418 aa14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 CTAGE6Q86UF2 777 aa14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 KIF18BQ86Y91 864 aa14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 ULK2Q8IYT8 1036 aa14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 OR56A3Q8NH54 315 aa14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 PYCR2Q96C36 320 aa14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 HIST1H2AJQ99878 128 aa14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 H2AFJQ9BTM1 129 aa14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa14.49□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 TGFBR3LH3BV60 316 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 CLDN4O14493 209 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 ARHGEF9O43307 516 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 P04436 131 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 TPSB2P20231 275 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 PCSK6P29122 969 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 HK2P52789 917 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 SLC13A2Q13183 592 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 SP140Q13342 867 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 TPSAB1Q15661 275 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 PHKG1Q16816 387 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 CASC4Q6P4E1 433 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 POMZP3Q6PJE2 187 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 FBXW8Q8N3Y1 598 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 ANKRD53Q8N9V6 530 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 NAXEQ8NCW5 288 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 TNIP2Q8NFZ5 429 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 NEIL2Q969S2 332 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 ADAP2Q9NPF8 381 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 ATG4BQ9Y4P1 393 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.48□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 SONP18583 2426 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 DOCK7Q96N67 2140 aa14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 MAGEB16A2A368 324 aa14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 C4orf51C9J302 202 aa14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 HAUS5O94927 633 aa14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 GOSR1O95249 250 aa14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 EPPINO95925 133 aa14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 SERPINA6P08185 405 aa14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 RGS4P49798 205 aa14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 BTN3A2P78410 334 aa14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 RUNX2Q13950 521 aa14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 CCNG2Q16589 344 aa14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 OPN5Q6U736 354 aa14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 LINC01560Q8TB33 94 aa14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 SLC5A11Q8WWX8 675 aa14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 COX4I2Q96KJ9 171 aa14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 AICDAQ9GZX7 198 aa14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 ARL15Q9NXU5 204 aa14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 CLCA1A8K7I4 914 aa14.46□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 AHRRA9YTQ3 701 aa14.46□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 CCL3P10147 92 aa14.46□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 TIMP3P35625 211 aa14.46□□□□□ -0.09
SBNO2-205ENST00000587655 SLC1A2P43004 574 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms