RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 PDE7AQ13946 482 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TGIF1Q15583 401 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 FXNQ16595 210 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 MAPKAPK3Q16644 382 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ZNF542PQ5EBM4 170 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 MANEAQ5SRI9 462 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 LRIF1Q5T3J3 769 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 FBXW10Q5XX13 1052 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 PAGE2Q7Z2X7 111 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 COMMD6Q7Z4G1 85 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 SLC15A3Q8IY34 581 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ARL14Q8N4G2 192 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 NATD1Q8N6N6 113 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 WDR60Q8WVS4 1066 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 JADE3Q92613 823 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 VPS33AQ96AX1 596 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 CLPTM1LQ96KA5 538 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 SH3GL1Q99961 368 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 DPH7Q9BTV6 452 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 OR51B5Q9H339 312 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 DCLRE1BQ9H816 532 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 RMND5AQ9H871 391 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 MYNNQ9NPC7 610 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 PCM1Q15154 2024 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 A0A096LPI6 279 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 LRIT2A6NDA9 550 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 LILRA5A6NI73 299 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ISM1B1AKI9 464 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ACOT8O14734 319 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 AQP9O43315 295 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 OR1F1O43749 312 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 PCDH7O60245 1069 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 FKBP6O75344 327 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 PIAS2O75928 621 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 GP1BAP07359 652 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 S100A3P33764 101 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 BSGP35613 385 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 DGKQP52824 942 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 CYP4F2P78329 520 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 PHC1P78364 1004 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ZNF763Q0D2J5 394 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 NFYCQ13952 458 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 UGT8Q16880 541 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TIGD2Q4W5G0 525 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 SPANXN4Q5MJ08 99 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 FAM71E1Q6IPT2 247 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 NANOGP8Q6NSW7 305 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 KLHL35Q6PF15 583 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 GPR180Q86V85 440 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 HPS6Q86YV9 775 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 GOLM1Q8NBJ4 401 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 OR8J3Q8NGG0 315 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 NT5CQ8TCD5 201 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TMEM125Q96AQ2 219 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 RGMAQ96B86 450 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ASB9Q96DX5 294 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TM4SF19Q96DZ7 209 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ITCHQ96J02 903 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 EGLN2Q96KS0 407 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TSSK3Q96PN8 268 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 OR52E6Q96RD3 313 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 CENPKQ9BS16 269 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 RAB33BQ9H082 229 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 MUC13Q9H3R2 512 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 NANOGQ9H9S0 305 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 SERHLQ9NQF3 203 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ACTR10Q9NZ32 417 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 PILRAQ9UKJ1 303 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa11.35□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa11.34□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa11.34□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 OR6C74A6NCV1 312 aa11.34□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 OR5K3A6NET4 321 aa11.34□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 PRORSD1PA6NEY8 169 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms