RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 HTR3AP46098 478 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 SPINT3P49223 89 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 RAB28P51157 221 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 LSM3P62310 102 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF773Q6PK81 442 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 BIRC7Q96CA5 298 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 COQ8BQ96D53 544 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 SCRN2Q96FV2 425 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 MNTQ99583 582 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 RNF11Q9Y3C5 154 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 GMEB1Q9Y692 573 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 OR51F1A6NGY5 319 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 CFL1P23528 166 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 CDH11P55287 796 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 LINGO2Q7L985 606 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 TICAM1Q8IUC6 712 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 PLEKHO2Q8TD55 490 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 AUTS2Q8WXX7 1259 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 GALPQ9UBC7 116 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 BTNL2Q9UIR0 455 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 L7N2F9 121 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 PCDHGA12O60330 932 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 KDM4BO94953 1096 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 C6orf47O95873 294 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 NCK1P16333 377 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 CD9P21926 228 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 PEX2P28328 305 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 VAMP2P63027 116 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 C6orf120Q7Z4R8 191 aa8.18□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 KLK6Q92876 244 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 TM9SF2Q99805 663 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 GIN1Q9NXP7 522 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 DKK3Q9UBP4 350 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 PRKD3O94806 890 aa8.18□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 SLC35G1Q2M3R5 365 aa8.18□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 OR6N1Q8NGY5 312 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 MR1Q95460 341 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 PKP4Q99569 1192 aa8.18□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 NELFAQ9H3P2 528 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 IL37Q9NZH6 218 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 PACSIN3Q9UKS6 424 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 TYROBPO43914 113 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 ABCB7O75027 752 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 CCNKO75909 580 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 FOXK1P85037 733 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 PTGR1Q14914 329 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 CSNK1A1LQ8N752 337 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 OR6K6Q8NGW6 343 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 SLC25A36Q96CQ1 311 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 SLC7A11Q9UPY5 501 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 ITM2AO43736 263 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 SEMA4FO95754 770 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 HRGP04196 525 aa8.17□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 ADRB3P13945 408 aa8.17□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 NUP43Q8NFH3 380 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 BADQ92934 168 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 MCHR1Q99705 422 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 GHRLQ9UBU3 117 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 KCNK6Q9Y257 313 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 MYH2Q9UKX2 1941 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PQU0 124 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 A6NIZ1 184 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 SLC22A31A6NKX4 558 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 NPIPA2E9PIF3 369 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 NPIPA3F8WFD2 350 aa8.17□□□□□ -1.1
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