RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532474.5

RCN1-208, Transcript of reticulocalbin 1, human

TSL 3

Gene RCN1, Length 714 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCN1-208	ENST00000532474	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	NR4A3	Q92570	626 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	UBE2E3	Q969T4	207 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	KIAA1191	Q96A73	305 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	MOCOS	Q96EN8	888 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	PEX11G	Q96HA9	241 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	FAR2	Q96K12	515 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	RBBP8	Q99708	897 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	DPH5	Q9H2P9	285 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	NT5DC2	Q9H857	520 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	KCNK13	Q9HB14	408 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	LANCL2	Q9NS86	450 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	WWOX	Q9NZC7	414 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	COPG2	Q9UBF2	871 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	FLNC	Q14315	2725 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474		A8MUI8	341 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	E2F3	O00716	465 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	CLGN	O14967	610 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	PRAMEF2	O60811	474 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	CLEC3A	O75596	197 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	RASAL1	O95294	804 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	CELA2A	P08217	269 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	STS	P08842	583 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	CCDC166	P0CW27	439 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	ITGAM	P11215	1152 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	CD1D	P15813	335 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	GDF5	P43026	501 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	MAGEA4	P43358	317 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	EFNA3	P52797	238 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	PGGT1B	P53609	377 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	HSD17B7	P56937	341 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	OR4D2	P58180	307 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	RAB8A	P61006	207 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	ID3	Q02535	119 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	C2orf54	Q08AI8	447 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	LAPTM5	Q13571	262 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	TBCC	Q15814	346 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	PDK4	Q16654	411 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	OGFOD2	Q6N063	350 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	BEST3	Q8N1M1	668 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	PDPR	Q8NCN5	879 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	WDR34	Q96EX3	536 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RCN1-208	ENST00000532474	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		5.74	□□□□□ -1.49

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