RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 RB1P06400 928 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 MPC1LP0DKB6 136 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 C6P13671 934 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 TIMP2P16035 220 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 CSNK1DP48730 415 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 CSNK2BP67870 215 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 IL18R1Q13478 541 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 DHCR24Q15392 516 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 ARMC6Q6NXE6 501 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 C16orf78Q8WTQ4 265 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 UCK2Q9BZX2 261 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 MAGIXQ9H6Y5 334 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 VNN3Q9NY84 501 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 ENPP5Q9UJA9 477 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 WDR81Q562E7 1941 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 VNN2O95498 520 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 NFATC1O95644 943 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 CD160O95971 181 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 TALDO1P37837 337 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 CCR8P51685 355 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 MVKQ03426 396 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 TGM3Q08188 693 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 LRRC32Q14392 662 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 LIPIQ6XZB0 460 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 KRT74Q7RTS7 529 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 BEX2Q9BXY8 128 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 IL37Q9NZH6 218 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 HSFX1Q9UBD0 423 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 IGLON5A6NGN9 336 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF860A6NHJ4 632 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 KIAA0513O60268 411 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 CDRT1O95170 752 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 SAGP10523 405 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 BMP7P18075 431 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP12.24□□□□□ -0.453e-11■■■■□ 19.9
RABGEF1-211ENST00000503687 IFNGR2P38484 337 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 MTAPQ13126 283 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 C6orf183Q5T699 404 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 HTR3DQ70Z44 454 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 C6orf120Q7Z4R8 191 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 MMP21Q8N119 569 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 OR4E2Q8NGC2 313 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 OR5D16Q8NGK9 328 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 TTTY10Q9BZA0 68 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 GPR52Q9Y2T5 361 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 KRBA1A5PL33 1030 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC182A6NF36 153 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 C1QCP02747 245 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 IDSP22304 550 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 ISL1P61371 349 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 SELENOWP63302 87 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 GPR68Q15743 365 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 BHLHB9Q6PI77 547 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 OOSP2Q86WS3 158 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 NUDT13Q86X67 352 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 LCN9Q8WX39 176 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 DSN1Q9H410 356 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 PEX16Q9Y5Y5 336 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 CENPXA8MT69 81 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 M0R3H8 397 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 GUCY1B2O75343 617 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 IMPA1P29218 277 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC9A5Q14940 896 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 NIPAL1Q6NVV3 410 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 LRRTM4Q86VH4 590 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 C10orf111Q8N326 155 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 FCGR1BQ92637 280 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 DNASE1L2Q92874 299 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 BADQ92934 168 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM19Q96HH6 336 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC6A16Q9GZN6 736 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 RETREG1Q9H6L5 497 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 RNF167Q9H6Y7 350 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 ANHXE9PGG2 379 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 KLK8O60259 260 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 ABLIM3O94929 683 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 PFN3P60673 137 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP2R2BQ00005 443 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 GSTM4Q03013 218 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 IL18Q14116 193 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 TCEAL5Q5H9L2 206 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 BTLAQ7Z6A9 289 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 LHFPL3Q86UP9 236 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 GALNT13Q8IUC8 556 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 KLHL6Q8WZ60 621 aa12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms