RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 NDNQ99608 321 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM173AQ9BQD7 235 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-171P-201ENST00000384354 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-171P-201ENST00000384354 LDAHQ9H6V9 325 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-171P-201ENST00000384354 IL1RL2Q9HB29 575 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-171P-201ENST00000384354 JKAMPQ9P055 326 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYOTQ9UBF9 498 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-171P-201ENST00000384354 INTUQ9ULD6 942 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-171P-201ENST00000384354 EFR3BQ9Y2G0 817 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-171P-201ENST00000384354 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC6A5Q9Y345 797 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-171P-201ENST00000384354 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A1W2PS29 197 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRBC2A0A5B9 178 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 SUSD5O60279 629 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRAMEF4O60810 478 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 TJP3O95049 919 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 FTCDO95954 541 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 ESR1P03372 595 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC35G6P0C7Q6 338 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 MPC1LP0DKB6 136 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 RNH1P13489 461 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 CNR1P21554 472 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 CERS1P27544 350 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC1A2P43004 574 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 SCTRP47872 440 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTH2RP49190 550 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 RWDD2BP57060 319 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCZ1BP86790 482 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP2R2BQ00005 443 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 REEP5Q00765 189 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 ASPHQ12797 758 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 DUSP8Q13202 625 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 TNK1Q13470 666 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRIM14Q14142 442 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC10A1Q14973 349 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 HERC3Q15034 1050 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 PCID2Q5JVF3 399 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 HECTD2Q5U5R9 776 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANKRD22Q5VYY1 191 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF470Q6ECI4 717 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 HMBOX1Q6NT76 420 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 UGT3A1Q6NUS8 523 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 RTL4Q6ZR62 310 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 GK5Q6ZS86 529 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 VN1R5Q7Z5H4 357 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 LINC00523Q86TU6 105 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 C17orf64Q86WR6 236 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRRC6Q86X45 466 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 CILP2Q8IUL8 1156 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 P3H2Q8IVL5 708 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 C9orf40Q8IXQ3 194 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 GCNT2Q8N0V5 402 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 TC2NQ8N9U0 490 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 SIMC1Q8NDZ2 872 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABHD11Q8NFV4 315 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR10G3Q8NGC4 313 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR4K1Q8NGD4 311 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 NEIL3Q8TAT5 605 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 NT5CQ8TCD5 201 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 MCOLN3Q8TDD5 553 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 NEIL2Q969S2 332 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 MARK4Q96L34 752 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 QRFPRQ96P65 431 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 TTC1Q99614 292 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 YIPF4Q9BSR8 244 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 G6PC3Q9BUM1 346 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIFC1Q9BW19 673 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR8D2Q9GZM6 311 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 EXO5Q9H790 373 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 UBTD1Q9HAC8 227 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC24A3Q9HC58 644 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM114A2Q9NRY5 505 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 B4GALT7Q9UBV7 327 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADGRE2Q9UHX3 823 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANAPC5Q9UJX4 755 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF148Q9UQR1 794 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 TESMINQ9Y4I5 508 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 SH3D21A4FU49 640 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 WASHC1A8K0Z3 465 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 HSPB2A8KAH6 182 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 C17orf51A8MQB3 221 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-171P-201ENST00000384354 B4DXG7 233 aa4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.2 ms