RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLEC5AQ9NY25 188 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 GIMAP2Q9UG22 337 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITGA11Q9UKX5 1188 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 MGAT4AQ9UM21 535 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPATA2Q9UM82 520 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 PFASO15067 1338 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKDD1BA6NHY2 528 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMCO5BA8MYB1 307 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTDSPLO15194 276 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR46O15213 610 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 P2RX6O15547 441 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLN5O75503 358 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR6B1O95007 311 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHG1P01857 330 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM200BP0CF97 657 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACKR3P25106 362 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPRP35270 261 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ELK3P41970 407 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 IER3P46695 156 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC1A6P48664 564 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR50Q13585 617 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 RUNX3Q13761 415 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSMD6Q15008 389 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 PM20D1Q6GTS8 502 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEPROQ6NW34 567 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 NLRP14Q86W24 1093 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBC1D10CQ8IV04 446 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBED8Q8IZ13 594 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 NME8Q8N427 588 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 CARNMT1Q8N4J0 409 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD177Q8N6Q3 437 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA0895Q8NCT3 520 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 C8orf46Q8TAG6 207 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEPT8Q92599 483 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 RFT1Q96AA3 541 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SGF29Q96ES7 293 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCM2Q9BSQ5 444 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC39A8Q9C0K1 460 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 LIME1Q9H400 295 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 VIPAS39Q9H9C1 493 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SH3GLB2Q9NR46 395 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABCD2Q9UBJ2 740 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR132Q9UNW8 380 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 VSIG4Q9Y279 399 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SALL1Q9NSC2 1324 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ST8SIA3O43173 380 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBCAO75347 108 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEMA4FO95754 770 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 LYNP07948 512 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 HCKP08631 526 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANPEPP15144 967 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 IFNAR1P17181 557 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP12-2P59991 146 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 FKBP1BP68106 108 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSPY1Q01534 308 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC3A1Q07837 685 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q1RN00 199 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 VWA2Q5GFL6 755 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 NHLRC3Q5JS37 347 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM64Q6YI46 380 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SERINC5Q86VE9 423 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 HIPK1Q86Z02 1210 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHL7Q8IXQ5 586 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLEC1AQ8NC01 280 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SAP25Q8TEE9 199 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 CKAP2Q8WWK9 683 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 CORO2AQ92828 525 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM162AQ96A26 154 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 APOL2Q9BQE5 337 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR173Q9NS66 373 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNFRSF19Q9NS68 423 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 MED17Q9NVC6 651 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMED7Q9Y3B3 224 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ETV7Q9Y603 341 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPQQ9Y646 472 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 M0R296 226 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC30A4O14863 429 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 VENTXO95231 258 aa2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms