RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 IL3P08700 152 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 CD40LGP29965 261 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP2K3P46734 347 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 GHRHRQ02643 423 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 SSX6Q7RTT6 188 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 ZFAND4Q86XD8 727 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A0D9SEW6 157 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 SOCS2O14508 198 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 INHAP05111 366 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 UNC50Q53HI1 259 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM86B1Q8N7N1 296 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP17A1P05093 508 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 FXYD6P3P58550 94 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 Q8N402 240 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 FNDC8Q8TC99 324 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 C17orf62Q9BQA9 187 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 DENRO43583 198 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 C14orf80Q86SX3 495 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 CBLP22681 906 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC27A4Q6P1M0 643 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 HMGB4Q8WW32 186 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 OR12D1P0DN82 309 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC9A3P48764 834 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 CEACAM7Q14002 265 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ALG10Q5BKT4 473 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 OR4K17Q8NGC6 315 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ADH7P40394 386 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 OR2B2Q9GZK3 357 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 AIG1Q9NVV5 245 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM118AQ9NWS6 357 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 IFT52Q9Y366 437 aa23.26■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA0513O60268 411 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 AHSA1O95433 338 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ACRP10323 421 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRN1Q6UXK5 716 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 OR6N2Q8NGY6 317 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 RHEBL1Q8TAI7 183 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 PNPLA2Q96AD5 504 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 LGALS12Q96DT0 336 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 MEN1O00255 615 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 EPOP01588 193 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 SOX2P48431 317 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 GABARAPL2P60520 117 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 OR5M3Q8NGP4 307 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 SRRDQ9UH36 339 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 E7ESA3 106 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF13O43567 381 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 GTF2F2P13984 249 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 HERV-K104P61576 105 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 CLCA4Q14CN2 919 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 HSD17B12Q53GQ0 312 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 HMBOX1Q6NT76 420 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 OR5P2Q8WZ92 322 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 MSANTD3Q96H12 275 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 CRTAC1Q9NQ79 661 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 PARPBPQ9NWS1 579 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR89AB7ZAQ6 455 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 H0YJX3 145 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 MUSKO15146 869 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR89BP0CG08 455 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 HLCSP50747 726 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 GALNT11Q8NCW6 608 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 STYXL1Q9Y6J8 313 aa23.25■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 UNC119BA6NIH7 251 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 GARNL3Q5VVW2 1013 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 GLT8D1Q68CQ7 371 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 SMYD5Q6GMV2 418 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 B4GALT6Q9UBX8 382 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ANXA3P12429 323 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 C22orf42Q6IC83 251 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 OR5T2Q8NGG2 359 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 C1orf74Q96LT6 269 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC5A7Q9GZV3 580 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 TAS2R3Q9NYW6 316 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 GKP32189 559 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ID2Q02363 134 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC36A3Q495N2 470 aa23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms