RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 FAR1Q8WVX9 515 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 MARVELD3Q96A59 401 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 SLX1AQ9BQ83 275 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 NTMT1Q9BV86 223 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 TCF7L2Q9NQB0 619 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ENAMQ9NRM1 1142 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 TXLNGQ9NUQ3 528 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC22A2O15244 555 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ZG16O60844 167 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 OTCP00480 354 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 UROSP10746 265 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 EDN3P14138 238 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGP20916 626 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC6A12P48065 614 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDH1Q08174 1060 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 GTF2H2Q13888 395 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP70Q8NHQ1 597 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEC3Q8TD91 643 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM79Q9BSE2 394 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 NDC1Q9BTX1 674 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC26A1Q9H2B4 701 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 WWOXQ9NZC7 414 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 OPTCQ9UBM4 332 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 POLG2Q9UHN1 485 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 POLQO75417 2590 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 GUCA1CO95843 209 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ENO1P06733 434 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 KIR2DS3Q14952 304 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 DTWD1Q8N5C7 304 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJB14Q8TBM8 379 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 NMUR2Q9GZQ4 415 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR54Q9H977 334 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 TACC2O95359 2948 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1B0GX78 115 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP10A1A4S6 786 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGEF33A8MVX0 844 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ALBP02768 609 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 STSP08842 583 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 EPB42P16452 691 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 PKLRP30613 574 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 BTKQ06187 659 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 GRB7Q14451 532 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 TTLL10Q6ZVT0 673 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF285Q96NJ3 590 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 NUF2Q9BZD4 464 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 CTSFQ9UBX1 484 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 CAPN14A8MX76 684 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ISM1B1AKI9 464 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP6CO00743 305 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 SDHDO14521 159 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 UNC5CO95185 931 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf105O95561 183 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 CHEK2O96017 543 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 HSPA7P48741 367 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 FCRL6Q6DN72 434 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 PARP9Q8IXQ6 854 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 TEX9Q8N6V9 391 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 AGR3Q8TD06 166 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 AGAP4Q96P64 663 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC106Q9BWC9 280 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 IPPKQ9H8X2 491 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF225Q9UK10 706 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ASB1Q9Y576 335 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA8OA6NCC3 632 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 VSTM2BA6NLU5 285 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA8NF8WBI6 632 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO1CO00159 1063 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 MED26O95402 600 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ALAS2P22557 587 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 RASSF2P50749 326 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 CHSY3Q70JA7 882 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 CATSPER1Q8NEC5 780 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 OR11G2Q8NGC1 345 aa22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms