RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598697.5

TRPM4-211, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily M member 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRPM4, Length 3,349 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM4-211ENST00000598697 PGBD3Q8N328 593 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 RNF34Q969K3 372 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 TBL1YQ9BQ87 522 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 KRT84Q9NSB2 600 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 GALPQ9UBC7 116 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 SRRDQ9UH36 339 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 FAM50BQ9Y247 325 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 SLC43A1O75387 559 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 BEST1O76090 585 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 PRAMEF1O95521 474 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 IDH2P48735 452 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 KEAP1Q14145 624 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 RBBP7Q16576 425 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 KLHL22Q53GT1 634 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 C9orf152Q5JTZ5 239 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 SUSD1Q6UWL2 747 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 MGLLQ99685 303 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 CACNG4Q9UBN1 327 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 SEC14L4Q9UDX3 406 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPM4-211ENST00000598697 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 AP2A2O94973 939 aa14.71□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 G6PDP11413 515 aa14.71□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 SYN1P17600 705 aa14.71□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 GGT1P19440 569 aa14.71□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 SDHBP21912 280 aa14.71□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 STARP49675 285 aa14.71□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 ARSDP51689 593 aa14.71□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 ITKQ08881 620 aa14.71□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 SLC27A4Q6P1M0 643 aa14.71□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.71□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 KIAA1191Q96A73 305 aa14.71□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 CHD5Q8TDI0 1954 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 DCLK1O15075 740 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 TGM6O95932 706 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 HBQ1P09105 142 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 STOMP27105 288 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 MAPK1P28482 360 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 ALDH9A1P49189 494 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 PGDP52209 483 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 NUBP1P53384 320 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 ST3GAL4Q11206 333 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 FTMTQ8N4E7 242 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 GGHQ92820 318 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 CRELD1Q96HD1 420 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 PDCD10Q9BUL8 212 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 RNF39Q9H2S5 420 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 IKZF3Q9UKT9 509 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 KLK4Q9Y5K2 254 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 A0A0G2JMZ2 1700 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 ADRB1P08588 477 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 HLA-EP13747 358 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 CXCL3P19876 107 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 PSEN2P49810 448 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 DLEU7Q6UYE1 221 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 RAB11FIP2Q7L804 512 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 OR11H7Q8NGC8 314 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 NETO1Q8TDF5 533 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 WBP1Q96G27 269 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 SPHK1Q9NYA1 384 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 KIF25Q9UIL4 384 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 ASB1Q9Y576 335 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 MYADML2A6NDP7 307 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 EFCAB7A8K855 629 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 WRBO00258 174 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 SEC22BO75396 215 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 FAM189BP81408 668 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 PTGR1Q14914 329 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 TRAM2Q15035 370 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 MPEG1Q2M385 716 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 UAP1L1Q3KQV9 507 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 SGO1Q5FBB7 561 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 ANKRD46Q86W74 232 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 RHBDF1Q96CC6 855 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 COL21A1Q96P44 957 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TRPM4-211ENST00000598697 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms