RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580799.2

GGA3-210, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene GGA3, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-210ENST00000580799 ADAP2Q9NPF8 381 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 KCMF1Q9P0J7 381 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 MTORP42345 2549 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 FIGNL2A6NMB9 653 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 A8MVJ9 347 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 C4orf51C9J302 202 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 BCKDKO14874 412 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 OR2J2O76002 312 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 PDE9AO76083 593 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 GNAZP19086 355 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 ACVR2AP27037 513 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 NUP107P57740 925 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 BTN3A2P78410 334 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 CDKL1Q00532 357 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 PLGLB1Q02325 96 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 PMPCAQ10713 525 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 SLC13A2Q13183 592 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 MYBPHQ13203 477 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 RCN2Q14257 317 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 PPP1R3AQ16821 1122 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 GK5Q6ZS86 529 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 TMEM200AQ86VY9 491 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 OR2M7Q8NG81 312 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 ASB15Q8WXK1 588 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 NCLNQ969V3 563 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 UCK2Q9BZX2 261 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 DEFB127Q9H1M4 99 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 DEPPQ9NTK1 212 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 HPF1Q9NWY4 346 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 MYOTQ9UBF9 498 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 SLC22A14Q9Y267 594 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 VWA7Q9Y334 891 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 CTAGE15A4D2H0 777 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 LRIT2A6NDA9 550 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 NPIPA2E9PIF3 369 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 NPIPA3F8WFD2 350 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 ERI3O43414 337 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 B3GALT2O43825 422 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 KLK8O60259 260 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 ZWINTO95229 277 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 IGHG3P01860 377 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 SAT1P21673 171 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 FNTAP49354 379 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 RAB38P57729 211 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.884e-6■■■■■ 29
GGA3-210ENST00000580799 PPP1R7Q15435 360 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 GXYLT1Q4G148 440 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 HSDL2Q6YN16 418 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 RTL4Q6ZR62 310 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 CTAGE6Q86UF2 777 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 GAS2L3Q86XJ1 694 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 RPRMLQ8N4K4 120 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 GOLM1Q8NBJ4 401 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 NINJ1Q92982 152 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 MS4A6EQ96DS6 147 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 POM121Q96HA1 1249 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 RASL10BQ96S79 203 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 SMC6Q96SB8 1091 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 FAM173AQ9BQD7 235 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 CAPS2Q9BXY5 557 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 TTTY12Q9BZ98 90 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 AICDAQ9GZX7 198 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 JRKLQ9Y4A0 524 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 CLDN16Q9Y5I7 305 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 ITPR3Q14573 2671 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 TMEM200CA6NKL6 621 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 FAM166BA8MTA8 275 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 TGFBR3LH3BV60 316 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 SUSD5O60279 629 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 WDR1O75083 606 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 CLEC3AO75596 197 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 GLSO94925 669 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 OR6B1O95007 311 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 CD99P14209 185 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 CNR1P21554 472 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-210ENST00000580799 PPP2R1BP30154 601 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms