RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 NUP107P57740 925 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 PPIAP62937 165 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 TFF3Q07654 80 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 SLC13A2Q13183 592 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 RUNX2Q13950 521 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 PPP1R7Q15435 360 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 GXYLT1Q4G148 440 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 EMC4Q5J8M3 183 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 CES4AQ5XG92 561 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 FAM45BPQ6NSW5 357 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 SBSNQ6UWP8 590 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 ACAD11Q709F0 780 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 GALNT7Q86SF2 657 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 SCUBE1Q8IWY4 988 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 PSD4Q8NDX1 1056 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 FAM45AQ8TCE6 357 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 ASB15Q8WXK1 588 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 CCT6BQ92526 530 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 SEC16BQ96JE7 1060 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 NAT9Q9BTE0 207 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa15.81■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 ACOT7O00154 380 aa15.8■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 HSD17B7P56937 341 aa15.8■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 MYBPHQ13203 477 aa15.8■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 BMPR2Q13873 1038 aa15.8■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 BBS9Q3SYG4 887 aa15.8■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 MSS51Q4VC12 460 aa15.8■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 XKR6Q5GH73 641 aa15.8■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 TMEM52Q8NDY8 209 aa15.8■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 OR5M9Q8NGP3 310 aa15.8■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa15.8■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 GAL3ST3Q96A11 431 aa15.8■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 EGFL8Q99944 293 aa15.8■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 PNPLA3Q9NST1 481 aa15.8■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 KCNN3Q9UGI6 736 aa15.8■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 TGFBR3LH3BV60 316 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 WWP2O00308 870 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 CDC7O00311 574 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 ERI3O43414 337 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 OR6B1O95007 311 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 NADKO95544 446 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 IFNA16P05015 189 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 FNTAP49354 379 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 RAB38P57729 211 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 CCZ1BP86790 482 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 PPP1R3AQ16821 1122 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 ZNF585AQ6P3V2 769 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 CLNKQ7Z7G1 428 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 SLC22A16Q86VW1 577 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 IGDCC3Q8IVU1 814 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 FAM47BQ8NA70 645 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 OR2M7Q8NG81 312 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 CFAP36Q96G28 342 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 ADAP2Q9NPF8 381 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 MYOTQ9UBF9 498 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 ASIC3Q9UHC3 531 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 JRKLQ9Y4A0 524 aa15.79■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 ZNF407Q9C0G0 2248 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 A0A088AWK7 358 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 TMEM200CA6NKL6 621 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 G3V3Y1 287 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 B3GALT2O43825 422 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 WDR47O94967 919 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 GNAZP19086 355 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 SOX3P41225 446 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 ZNF750Q32MQ0 723 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 HSDL2Q6YN16 418 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 RGS9BPQ6ZS82 235 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 ZNF595Q8IYB9 648 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 CLYBLQ8N0X4 340 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 TTLQ8NG68 377 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 MS4A6EQ96DS6 147 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 RASL10BQ96S79 203 aa15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms