RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 JADE3Q92613 823 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 TFAP2CQ92754 450 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 MYLPFQ96A32 169 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 OTUB2Q96DC9 234 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 MRGPRX1Q96LB2 322 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 C7orf26Q96N11 449 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 FIZ1Q96SL8 496 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 ACOX2Q99424 681 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 GABRG3Q99928 467 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 NEURL2Q9BR09 285 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 BBS2Q9BXC9 721 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 HOXD1Q9GZZ0 328 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 GAREM1Q9H706 876 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 EPB41L5Q9HCM4 733 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 S100A14Q9HCY8 104 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 TXLNGQ9NUQ3 528 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 DEC1Q9P2X7 70 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 STYXL1Q9Y6J8 313 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 USH1CQ9Y6N9 552 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 V9GYQ6 96 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 PCSK5Q92824 1860 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 HMX3A6NHT5 357 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 ZAR1LA6NP61 321 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 IQCF5A8MTL0 148 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 EVPLLA8MZ36 301 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 B9A039 149 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 J3QKU1 62 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 EXOC3O60645 756 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 ATP2C2O75185 946 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 CCNKO75909 580 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 IL18RAPO95256 599 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 FAM107AO95990 144 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 KRT8P05787 483 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 PKMP14618 531 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 CD6P30203 668 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 SLC5A2P31639 672 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 CRHR1P34998 444 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 HMGCLP35914 325 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 SERPINB5P36952 375 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 MATKP42679 507 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 KIR3DL2P43630 455 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 LHX1P48742 406 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 CACNA2D1P54289 1103 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 LRMPQ12912 555 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 BAMBIQ13145 260 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 KCNJ8Q15842 424 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 HLA-BQ31612 363 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 TMEM119Q4V9L6 283 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 GPAT3Q53EU6 434 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 SGO1Q5FBB7 561 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 C10orf120Q5SQS8 335 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 SULT1C3Q6IMI6 304 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 FRA10AC1Q70Z53 315 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 HPS6Q86YV9 775 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 HIPK1Q86Z02 1210 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 LRRC52Q8N7C0 313 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 ZNF366Q8N895 744 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 ZNF781Q8N8C0 355 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 PSD4Q8NDX1 1056 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 OR13C2Q8NGS9 318 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 ADAMTS15Q8TE58 950 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 SLC20A1Q8WUM9 679 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 PHF21BQ96EK2 531 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 CALML4Q96GE6 196 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 C17orf62Q9BQA9 187 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 SPASTQ9UBP0 616 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 BTBD3Q9Y2F9 522 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 CLDN16Q9Y5I7 305 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 GPR45Q9Y5Y3 372 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 FLNCQ14315 2725 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 MEI4A8MW99 385 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 H0YAE9 185 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 PGLSO95336 258 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 IL1AP01583 271 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 FABP1P07148 127 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 HLA-EP13747 358 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 CD79BP40259 229 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 RAD23BP54727 409 aa7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms