RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PACS1-208ENST00000529677 C10orf90Q96M02 699 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-208ENST00000529677 C3orf30Q96M34 536 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-208ENST00000529677 HBEGFQ99075 208 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-208ENST00000529677 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PACS1-208ENST00000529677 NMRK1Q9NWW6 199 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-208ENST00000529677 VPS29Q9UBQ0 182 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-208ENST00000529677 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-208ENST00000529677 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-208ENST00000529677 ITPR3Q14573 2671 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 GMNCA6NCL1 334 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 URADA6NGE7 173 aa15.95■□□□□ 0.14
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PACS1-208ENST00000529677 RGS14O43566 566 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 VPS4BO75351 444 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 TGFB1P01137 390 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 LINC00032P0C843 101 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 KITP10721 976 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 DRD4P21917 467 aa15.95■□□□□ 0.14
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PACS1-208ENST00000529677 SMU1Q2TAY7 513 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 ABHD17CQ6PCB6 329 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 SCIMPQ6UWF3 145 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 UBE3DQ7Z6J8 389 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 PPP1R3BQ86XI6 285 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 DDIASQ8IXT1 998 aa15.95■□□□□ 0.14
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PACS1-208ENST00000529677 METTL4Q8N3J2 472 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 KCT2Q8NC54 265 aa15.95■□□□□ 0.14
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PACS1-208ENST00000529677 CCT6BQ92526 530 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 PMEPA1Q969W9 287 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 FCRL1Q96LA6 429 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 QRFPRQ96P65 431 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 F2RL3Q96RI0 385 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 MACROD1Q9BQ69 325 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 ZPBPQ9BS86 351 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 DDA1Q9BW61 102 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
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PACS1-208ENST00000529677 NUF2Q9BZD4 464 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 OR51B5Q9H339 312 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 KLHL31Q9H511 634 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 APMAPQ9HDC9 416 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 LHX9Q9NQ69 397 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 RIC8BQ9NVN3 520 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 SLC12A4Q9UP95 1085 aa15.95■□□□□ 0.14
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PACS1-208ENST00000529677 PLPP1O14494 284 aa15.94■□□□□ 0.14
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PACS1-208ENST00000529677 STATHP02808 62 aa15.94■□□□□ 0.14
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PACS1-208ENST00000529677 SERPIND1P05546 499 aa15.94■□□□□ 0.14
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PACS1-208ENST00000529677 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 ACPPP15309 386 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 COL8A1P27658 744 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 ARSFP54793 590 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 RIPPLY3P57055 190 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 HMGCS1Q01581 520 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 FOXM1Q08050 763 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 FAM214AQ32MH5 1076 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 GALNT18Q6P9A2 607 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 CEACAM20Q6UY09 585 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 ACTRT2Q8TDY3 377 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 CHTF18Q8WVB6 975 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 RGMAQ96B86 450 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 MVB12AQ96EY5 273 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 CENPKQ9BS16 269 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 TBCDQ9BTW9 1192 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 KCNK13Q9HB14 408 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 ADAM29Q9UKF5 820 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 POLQO75417 2590 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 MED26O95402 600 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 SPTBP11277 2137 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 ALOX12P18054 663 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 BSGP35613 385 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 AQP5P55064 265 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 TGM3Q08188 693 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 HERC3Q15034 1050 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 KIAA0040Q15053 153 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 NDUFA9Q16795 377 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 IMPG1Q17R60 797 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 MUM1Q2TAK8 710 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 SPIN4Q56A73 249 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 OGFOD2Q6N063 350 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 RHBDD2Q6NTF9 364 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-208ENST00000529677 NIPAL1Q6NVV3 410 aa15.93■□□□□ 0.14
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