RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa12.27□□□□□ -0.45
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RABGEF1-211ENST00000503687 CCR4P51679 360 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 SRP54P61011 504 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
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RABGEF1-211ENST00000503687 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP12.26□□□□□ -0.457e-8■■■■□ 26.4
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RABGEF1-211ENST00000503687 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
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RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF232Q9UNY5 417 aa12.26□□□□□ -0.45
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RABGEF1-211ENST00000503687 CDK20Q8IZL9 346 aa12.25□□□□□ -0.45
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RABGEF1-211ENST00000503687 FCRL4Q96PJ5 515 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 RDH14Q9HBH5 336 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
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RABGEF1-211ENST00000503687 PLOD3O60568 738 aa12.25□□□□□ -0.45
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