RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477464.1

SAR1A-208, Transcript of secretion associated Ras related GTPase 1A, humanhuman

TSL 2

Gene SAR1A, Length 529 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1A-208ENST00000477464 PIK3R3Q92569 461 aa4.59□□□□□ -1.67
SAR1A-208ENST00000477464 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SAR1A-208ENST00000477464 BPIFA2Q96DR5 249 aa4.59□□□□□ -1.67
SAR1A-208ENST00000477464 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SAR1A-208ENST00000477464 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SAR1A-208ENST00000477464 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SAR1A-208ENST00000477464 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SAR1A-208ENST00000477464 CBWD1Q9BRT8 395 aa4.59□□□□□ -1.67
SAR1A-208ENST00000477464 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SAR1A-208ENST00000477464 LAT2Q9GZY6 243 aa4.59□□□□□ -1.67
SAR1A-208ENST00000477464 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SAR1A-208ENST00000477464 VCX2Q9H322 139 aa4.59□□□□□ -1.67
SAR1A-208ENST00000477464 COG4Q9H9E3 785 aa4.59□□□□□ -1.67
SAR1A-208ENST00000477464 KIF16BQ96L93 1317 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 A8MVM7 634 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 FPGTO14772 594 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 SYNGR3O43761 229 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 KLHL41O60662 606 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 BAG4O95429 457 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 MT-ND2P03891 347 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 ATP1B1P05026 303 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 APRTP07741 180 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 CT45A8P0DMV1 189 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 CT45A9P0DMV2 189 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 PSG1P11464 419 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 CEACAM1P13688 526 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 HLA-DOBP13765 273 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 DRD5P21918 477 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 CALB2P22676 271 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 OTX2P32243 289 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 ADRA1AP35348 466 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 ALDH3B1P43353 468 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 ACADSBP45954 432 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 DNA2P51530 1060 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 BRWD1-AS2P59051 145 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 KRTAP10-2P60368 255 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 GABPAQ06546 454 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 Q0VFX4 171 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 TRAF3Q13114 568 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 SQLEQ14534 574 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 TMEM132DQ14C87 1099 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 CCDC142Q17RM4 750 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 ADPRMQ3LIE5 342 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 GPR33Q49SQ1 333 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 MPPE1Q53F39 396 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 CT45A2Q5DJT8 189 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 MTX3Q5HYI7 312 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 SIRPB2Q5JXA9 342 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 SPATA46Q5T0L3 261 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 MORN5Q5VZ52 161 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 NCR3LG1Q68D85 454 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 ZNF626Q68DY1 528 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 SLC24A5Q71RS6 500 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 GGNQ86UU5 652 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 ZNF679Q8IYX0 411 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 OR56B2PQ8NGI1 322 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 OR52K2Q8NGK3 314 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 OR13C2Q8NGS9 318 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 OR4L1Q8NH43 312 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 CHPT1Q8WUD6 406 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 NCLNQ969V3 563 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 TMEM45BQ96B21 275 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 C4orf45Q96LM5 186 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 KRT12Q99456 494 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 ZBTB18Q99592 522 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 CAPS2Q9BXY5 557 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 OR2B2Q9GZK3 357 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 RDH8Q9NYR8 311 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 SATB2Q9UPW6 733 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 SPACA6W5XKT8 324 aa4.58□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 A0A1W2PPI3 338 aa4.57□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 ZNF587BE7ETH6 402 aa4.57□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 PDXKO00764 312 aa4.57□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 CXCL11O14625 94 aa4.57□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 EPHB6O15197 1021 aa4.57□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 MATN3O15232 486 aa4.57□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 KRT86O43790 486 aa4.57□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 XPNPEP2O43895 674 aa4.57□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 HOXC6P09630 235 aa4.57□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 CD59P13987 128 aa4.57□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 CTNNA2P26232 953 aa4.57□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 OR1D2P34982 312 aa4.57□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 SLC1A6P48664 564 aa4.57□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 DLG1Q12959 904 aa4.57□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
SAR1A-208ENST00000477464 CUL2Q13617 745 aa4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms