RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 LAPTM4AQ15012 233 aa16.37■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 FAM124AQ86V42 546 aa16.37■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 NFKBIDQ8NI38 313 aa16.37■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 MPP4Q96JB8 637 aa16.37■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 NLNQ9BYT8 704 aa16.37■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ADNPQ9H2P0 1102 aa16.37■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 FGF22Q9HCT0 170 aa16.37■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 PRDM8Q9NQV8 689 aa16.37■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ADAM29Q9UKF5 820 aa16.37■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 PADI2Q9Y2J8 665 aa16.37■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 SERPIND1P05546 499 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 RPE65Q16518 533 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF691Q5VV52 312 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF773Q6PK81 442 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 CYP4Z1Q86W10 505 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 PLD3Q8IV08 490 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 PIK3C3Q8NEB9 887 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 TTLQ8NG68 377 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ASB12Q8WXK4 309 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 LHX9Q9NQ69 397 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 SNX8Q9Y5X2 465 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 TRBC2A0A5B9 178 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 PRSS38A1L453 326 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM229AB2RXF0 380 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 BCKDKO14874 412 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 SCAMP1O15126 338 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 PDPK1O15530 556 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 MITFO75030 526 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 IL7RP16871 459 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 DAPP51397 102 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 CDK6Q00534 326 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 IQCCQ4KMZ1 466 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 KDM4DQ6B0I6 523 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 USP30Q70CQ3 517 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC80Q76M96 950 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 GALNT5Q7Z7M9 940 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 SPPL2AQ8TCT8 520 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 OR5P2Q8WZ92 322 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 OR2M4Q96R27 311 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 CXorf36Q9H7Y0 433 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa16.36■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 KDM1AO60341 852 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 UGT2B11O75310 529 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 C9P02748 559 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 GRK3P35626 688 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 C6orf141Q5SZD1 244 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 FAM180BQ6P0A1 224 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 KCTD8Q6ZWB6 473 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 UBE3DQ7Z6J8 389 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 LZICQ8WZA0 190 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 EPS8L2Q9H6S3 715 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 RUBCNLQ9H714 662 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 KIF17Q9P2E2 1029 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 PIAS3Q9Y6X2 628 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 B4GAT1O43505 415 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 TMPRSS11DO60235 418 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 OPN1SWP03999 348 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ARAFP10398 606 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ACADMP11310 421 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 DRD1P21728 446 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 CRHBPP24387 322 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 SLC5A2P31639 672 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 TTKP33981 857 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 MANFP55145 182 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 KIAA1024LP59773 190 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ABATP80404 500 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 IL1RL1Q01638 556 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 CD47Q08722 323 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 MEP1AQ16819 746 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 BROXQ5VW32 411 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 OR4C11Q6IEV9 310 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 CREB3L4Q8TEY5 395 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 EPYCQ99645 322 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ABCG4Q9H172 646 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 RIBC2Q9H4K1 309 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 BLOC1S6Q9UL45 172 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ANGPT4Q9Y264 503 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa16.35■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 POM121BA6NF01 834 aa16.34■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 IFNA14P01570 189 aa16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms